[发明专利]昆虫RPA-LFD检测引物和探针以及检测方法在审
申请号: | 202310272097.0 | 申请日: | 2023-03-20 |
公开(公告)号: | CN116497127A | 公开(公告)日: | 2023-07-28 |
发明(设计)人: | 姚艳霞;李承锦;孙荟荃;林若竹;王小艺;赵文霞 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院森林生态环境与自然保护研究所(国家林业和草原局世界自然遗产保护研究中心) |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6844;C12Q1/6804;C12N15/11 |
代理公司: | 北京思元知识产权代理事务所(普通合伙) 11598 | 代理人: | 余光军;霍雪梅 |
地址: | 100091 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 昆虫 rpa lfd 检测 引物 探针 以及 方法 | ||
1.昆虫RPA-LFD检测引物和探针,其特征在于,所述的昆虫RPA-LFD检测引物选自以下第(1)组或第(2)组中的任何一组检测引物:
第(1)组检测引物:所述的检测引物由上游引物和下游引物组成,其中,所述上游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.1所示,所述的下游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.2所示;
第(2)组检测引物:所述的检测引物由上游引物和下游引物组成,其中,所述的上游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.4所示,所述的下游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.5所示;
所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.3所示。
2.根据权利要求1所述的昆虫RPA-LFD检测引物和探针,其特征在于,在所述检测引物的下游引物的5’端连接有生物素;
在探针的5’端连接有荧光基团;在探针的3’端连接有阻抑聚合酶延伸或扩增的修饰基团,优选的,所述阻抑聚合酶延伸或扩增的修饰基团是C3-Spacer;将距探针的3’端的第15个碱基胞嘧啶用四氢呋喃替换。
3.权利要求1或2所述的昆虫RPA-LFD检测引物和探针在检测苹小吉丁中的应用;优选的,所述昆虫是苹小吉丁。
4.昆虫RPA-LFD检测试剂盒,包括:冻干酶,复水缓冲液,昆虫RPA-LFD检测引物和探针,ddH2O,醋酸镁和胶体金试纸条;其特征在于,所述的昆虫RPA-LFD检测引物选自以下第(1)组或第(2)组中的任何一组检测引物:
第(1)组检测引物:所述的检测引物由上游引物和下游引物组成,其中,所述上游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.1所示,所述的下游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.2所示;
第(2)组检测引物:所述的检测引物由上游引物和下游引物组成,其中,所述的上游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.4所示,所述的下游引物的核苷酸序列为SEQ ID No.5所示;
所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.3所示。
5.根据权利要求4所述的昆虫RPA-LFD检测试剂盒,其特征在于,在所述检测引物的下游引物的5’端连接有生物素;
在探针的5’端连接有荧光基团;在探针的3’端连接有阻抑聚合酶延伸或扩增的修饰基团,优选的,所述阻抑聚合酶延伸或扩增的修饰基团是C3-Spacer;将距探针的3’端的第15个碱基胞嘧啶用四氢呋喃替换。
6.根据权利要求4所述的昆虫RPA-LFD检测试剂盒,其特征在于,所述胶体金试纸条在结合垫上预埋抗荧光素抗体,该抗荧光素抗体与胶体金相连;在检测线上预埋链霉亲和素;在质控线上预埋二抗,该二抗与抗荧光素抗体特异性结合。
7.权利要求4-6任何一项所述的昆虫RPA-LFD检测试剂盒在检测苹小吉丁中的应用;优选的,所述昆虫是苹小吉丁。
8.一种苹小吉丁的RPA-LFD检测方法,其特征在于,包括:
(1)提取待检测样品的DNA;(2)以待检测样品的DNA为模板,以权利要求1或2所述苹小吉丁RPA-LFD检测上、下引物和探针建立重组酶聚合酶扩增体系并进行扩增反应;(3)将扩增反应的产物用ddH2O稀释,将稀释后的扩增产物添加到胶体金试纸条的样品孔;当检测线与质控线均显示红色时,表明待检测样品中含有苹小吉丁;当检测线不显示红色,质控线显示红色时,表明待检测样品中不含有苹小吉丁;当质控线不显示红色时为无效检测结果。
9.根据权利要求8所述的苹小吉丁的RPA-LFD检测方法,其特征在于,步骤(2)中所建立的重组酶聚合酶扩增体系包括:苹小吉丁RPA-LFD检测上、下游引物各2.0μL,探针0.6μL,待检测的样品DNA模板2.0μL,ddH2O 11.5μL;以上混合均匀后,加入2.5μL的醋酸镁启动反应。
10.根据权利要求8所述的苹小吉丁的RPA-LFD检测方法,其特征在于,步骤(2)中所述的扩增反应包括38℃条件下反应10min。
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