[发明专利]免疫组织化学染色影像的分析方法在审
申请号: | 202211568161.1 | 申请日: | 2022-12-07 |
公开(公告)号: | CN116503311A | 公开(公告)日: | 2023-07-28 |
发明(设计)人: | 詹宝珠;蔡弘文;廖绍凯;郑国顺 | 申请(专利权)人: | 詹宝珠 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/90;G06T7/155;G06N3/0464 |
代理公司: | 北京律诚同业知识产权代理有限公司 11006 | 代理人: | 徐金国 |
地址: | 中国台湾台南市大*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 免疫 组织化学 染色 影像 分析 方法 | ||
本发明提出一种免疫组织化学染色影像的分析方法,包括:根据机器学习模型切割出免疫组织化学染色影像的多个细胞核;移除免疫组织化学染色影像中属于细胞核的像素以及移除符合一颜色范围的像素以取得多个细胞质像素;根据细胞质像素的位置将细胞质像素分配至细胞核以形成多个细胞;以及计算细胞中每个像素的像素染色分数,借此计算细胞的细胞染色分数。如此可以客观且自动化的计算出细胞被染色的分数。
技术领域
本发明是有关于免疫组织化学染色影像的分析方法,可以利用算法客观的评估每个细胞被染色的程度。
背景技术
免疫组织化学染色(immunohistochemistry,IHC)是一种广泛使用的方法,用以标记特定的有机物质。原理在于使用特定比例的抗原及抗体,可以让特定的抗原物质在切片的数字影像(whole slide image,WSI)中显示出来。免疫组织化学染色常用于医学研究,用以评估被染色细胞的病理参数,观察与癌症等疾病之间的关系。然而,传统的分析方法仰赖医生的主观判断,如何提出客观的分析方法为此领域技术人员所关心的议题。
发明内容
本发明提出一种免疫组织化学染色影像的分析方法,适用于计算机系统,此分析方法包括:根据机器学习模型切割出免疫组织化学染色影像的多个细胞核,其中免疫组织化学染色影像包括多个像素,像素包括多个颜色通道;移除免疫组织化学染色影像中属于细胞核的像素以及移除符合一颜色范围的像素以取得多个细胞质像素;根据细胞质像素的位置将细胞质像素分配至细胞核的其中之一以形成多个细胞;以及计算细胞中的像素的像素染色分数,借此计算细胞的细胞染色分数。
在一些实施例中,移除符合颜色范围的像素的步骤包括:将像素转换至色彩空间,色彩空间包含一色相、一饱和度与一明度;以及保留色相在一第一预设范围内以及饱和度在一第二预设范围内的像素,并且移除明度大于一第一临界值的像素。
在一些实施例中,根据细胞质像素的位置将细胞质像素分配至细胞核以形成细胞的步骤包括:将细胞核当作多个区域低点,将细胞质像素当作集水区,借此执行分水岭算法。
在一些实施例中,在形成细胞之后,分析方法还包括:计算细胞中的像素个数;以及如果细胞中的第一细胞的像素个数大于第二临界值且小于一第三临界值,删除第一细胞中的细胞质像素,并且加入根据第一细胞中的细胞核执行形态学扩张处理后的结果来形成第一细胞。
在一些实施例中,计算细胞中的像素的像素染色分数,借此计算细胞的细胞染色分数的步骤包括:根据细胞中的像素的饱和度与明度之间的比值来计算像素的像素染色分数;以及以个数作为权重,计算细胞中的像素的像素染色分数的权重平均以作为细胞的细胞染色分数。
为让本发明的上述特征和优点能更明显易懂,下文特举实施例,并配合附图作详细说明如下。
附图说明
图1是根据一实施例绘示免疫组织化学染色影像的分析方法的流程图。
图2是根据一实施例绘示取得细胞质像素的示意图。
图3是根据一实施例绘示分水岭算法的结果示意图。
图4是根据一实施例绘示根据HSV色彩空间来计算像素染色分数的示意图。
其中,附图标记:
101、102、201、301:免疫组织化学染色影像
111~114、211~212:步骤
121~123、202、203、302、303:图
410:范围
具体实施方式
关于本发明中所使用的「第一」、「第二」等,并非特别指次序或顺位的意思,其仅为了区别以相同技术用语描述的元件或操作。
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