[发明专利]一种用于非小细胞肺癌分型诊断的基因转录本标记物组合及分型诊断装置

说明书

本发明首次提供了一种用于非小细胞肺癌分型诊断的基因转录本标记物组合及分型诊断装置，该组合包含33个基因，分别是：LOC642587、S1PR5、BNC1、ATP1B3、LASS3、LONRF3、VSNL1、TRIM29、HNF1B、DSG3、CLCA2、TMPRSS11A、KRT17、GOLT1A、DLX5、E2F7、COL4A5、SLC39A2、TESC、FAT2、CALML3、KRT74、PVRL1、PRRG3、PERP、C4BPB、FZD7、DMGDH、OCLN、ARHGEF38、KRT5、CGN、LRRC66；该标记物组合可应用于肺腺癌、肺鳞癌组织分型的诊断中，诊断准确度可达96.64％。本发明提供的肺腺癌、肺鳞癌组织分型诊断装置，通过输入上述33个基因RNAseq的转录本count数，可对肺癌标本类型进行准确诊断；与传统病理形态学诊断相比，本发明提供的基因转录本标记物组合及分型诊断装置，具有准确度高、检测通量大、人为干扰低等优点，具有广泛的临床应用及推广价值。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种用于非小细胞肺癌分型诊断的基因转录本标记物组合及分型诊断装置。

背景技术

肺癌是当今世界最常见的恶性肿瘤之一，且是致死亡人数最多的肿瘤。肺癌可以分为小细胞肺癌和非小细胞肺癌，分别占比15％和85％。和其他恶性肿瘤类似，肺癌的生存期同其分期密切相关。非小细胞肺癌是由表观遗传改变引起的异质性疾病，具有高度肿瘤异质性。肿瘤异质性是癌症进展和耐药的重要原因。现有肺癌的治疗方式选择的主要依据是病理分型及分期，其中包括小细胞肺癌和非小细胞肺癌，肺腺癌(ADC)和肺鳞癌(SCC)等。临床上对肺癌作出诊断时，明确其病理分型对制订治疗方案、分析预后非常重要。不同组织亚型的肺癌，其相应的治疗策略也有所差异。对于非小细胞肺癌来说，腺癌的肿瘤细胞增殖速度比较快，通常在早期就会出现病灶转移，对化疗药物更敏感，而对放射治疗效果欠佳，因此常常选择手术、化疗、免疫、靶向等治疗方式。而鳞癌的肿瘤细胞生长稍慢一些，早期以局部侵犯为主，远处转移发生比较晚，所以鳞癌对放射治疗的敏感性更高，一般会采用手术、放射、免疫治疗等方式。

目前对肺癌的病理分型主要依靠组织形态学及免疫组化的方法。传统的病理组织学方法对病理技术员和病理医师的要求较高，进行结果判读时也存在一定的主观性。因此，开发一种客观、准确的基因标记物组合应用于非小细胞肺癌的组织分型诊断具有十分重要的意义。因此，针对肺癌分型诊断应用，本发明首次公开了一种用于非小细胞肺癌分型诊断的基因转录本标记物组合及分型诊断装置。

发明内容

为了填补现有技术的空白，本发明的目的在于提供一种用于非小细胞肺癌分型诊断的基因转录本标记物组合及分型诊断装置。

本发明解决上述技术问题的技术方案如下：

本发明的第一方面提供了一种基因转录本标记物组合，包括如下33个基因的转录本：LOC642587、S1PR5、BNC1、ATP1B3、LASS3、LONRF3、VSNL1、TRIM29、HNF1B、DSG3、CLCA2、TMPRSS11A、KRT17、GOLT1A、DLX5、E2F7、COL4A5、SLC39A2、TESC、FAT2、CALML3、KRT74、PVRL1、PRRG3、PERP、C4BPB、FZD7、DMGDH、OCLN、ARHGEF38、KRT5、CGN、LRRC66；所述标记物组合应用于肺腺癌、肺鳞癌的组织分型诊断；

进一步的，所述分型诊断的样本类型为非小细胞肺癌组织RNA；其组织分型诊断的准确度为96.64％。

本发明的第二方面提供了一种基于上述基因转录本标记物组合制备的肺癌分型诊断装置，所述装置包括检测模块和预测模块；具体地，通过输入所述标记物组合转录本的表达水平，即可对非小细胞肺癌组织是肺腺癌还是肺腺癌进行准确预测；

进一步的，所述检测模块包括总RNA提取试剂、逆转录试剂、建库试剂或测序试剂；