[发明专利]与西瓜果实可溶性固形物含量相关的SNP标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与西瓜果实可溶性固形物含量相关的SNP标记及其应用。所述的SNP位点位于西瓜基因组(97103，V2)第4号染色体的第5948359位核苷酸，该核苷酸为C或T。本发明得到的核苷酸多态性标记位点能够用于鉴定西瓜果实可溶性固形物含量。本发明不需要经过西瓜果实成熟期鉴定，在苗期就可以准确快速地鉴定出西瓜果实可溶性固形物含量，可以提高育种效率、缩短鉴定时间，适用于西瓜的遗传鉴定与育种。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及与西瓜果实可溶性固形物含量相关的SNP标记及其应用。

背景技术

作为一种重要的葫芦科作物，西瓜是人们夏季消暑解渴的重要水果，在世界园艺作物中占有非常重要的地位，中国是世界上西瓜生产和消费第一大国。果实可溶性固形物含量是西瓜的重要农艺性状之一，直接影响西瓜的品质和风味，是西瓜重要的育种指标。但是，现有技术关于西瓜果肉性状的研究主要集中在果肉颜色、果肉酸味、果肉硬度等的基因定位和标记开发上，关于西瓜果实可溶性固形物含量的研究相对较少。

SNP分子标记(single nucleotide polymorphisms，单核苷酸多态性)是指在基因组水平上由于单个核苷酸的突变所引起的DNA序列的改变。SNP分子标记广泛地存在于基因组上，具有通量高、简单、稳定、灵敏度高等特点，是目前分子标记辅助育种工作中极具发展前景的分子标记。

随着西瓜基因组时代的到来，明确西瓜重要农艺性状基因功能，寻找控制这些性状的关键基因，并开发相应的分子标记，将分子标记应用于育种，是目前西瓜育种工作的一项重要内容。因此，开发与西瓜果实可溶性固形物含量相关的分子标记并将其应用于西瓜育种工作，有助于加快西瓜育种进程。

发明内容

本发明的目的在于提供与西瓜果实可溶性固形物含量相关的SNP标记及其应用。

为了达到上述目的，本发明提供了与西瓜果实可溶性固形物含量相关的SNP标记，该标记位于西瓜基因组(97103，V2)第4号染色体的第5948359位，所述SNP标记的多态性为C或T。

具体的，若植株基因型为CC，则西瓜为甜西瓜，若植株基因型为TT，则西瓜为不甜西瓜；所述甜西瓜果实可溶性固形物含量大于6.0％，所述不甜西瓜果实可溶性固形物含量小于或等于6.0％。

本发明进一步请求保护与西瓜果实可溶性固形物含量相关的SNP标记在鉴定或辅助鉴定西瓜果实可溶性固形物含量与西瓜分子标记辅助育种中的应用。

本发明提供了一种鉴定或辅助鉴定西瓜果实可溶性固形物含量的方法，包括以下步骤：检测待测西瓜基因组中SNP位点的多态性，根据待测西瓜的SNP位点的多态性鉴定或辅助鉴定西瓜果实可溶性固形物含量。

本发明提供了一种西瓜育种的方法，包括以下步骤：检测待测西瓜基因组SNP位点的多态性，根据待测西瓜的SNP位点的多态性鉴定或辅助鉴定西瓜果实可溶性固形物含量，选择西瓜基因组中SNP的多态性为C的纯合型的西瓜作为亲本进行育种。

本发明提供了一种鉴定或辅助鉴定西瓜果实可溶性固形物含量的试剂盒，包括与西瓜果实可溶性固形物含量相关的SNP标记，所述SNP标记位于西瓜基因组(97103，V2)第4号染色体的第5948359位，所述SNP标记的多态性为C或T。

通过实施本发明的技术方案，可以达到以下有益效果：

(1)本发明提供的SNP标记检测西瓜果实可溶性固形物含量的准确率高，可以达到97％；

(2)本发明提供的鉴定西瓜果实可溶性固形物含量的方法，可以在西瓜苗期准确快速地鉴定出西瓜果实可溶性固形物含量，有效加速育种进程，提高育种效率。

附图说明

图1为SNP位点在不同碱基背景下的可溶性固形物含量统计图。

具体实施方式