[发明专利]一组用于三阴乳腺癌预后评估的基因集、试剂盒及其应用

说明书

本发明提供了一组用于三阴乳腺癌预后评估的基因集、试剂盒及其应用，属于预后评估技术领域，所述基因集包括PLPPR4、CA9、IGLL3P、SY CP2、SMIM22、GBE1、ALDOC和ZNF813，所述试剂盒的预后风险评分模型如下：风险评分＝(0.201×PLPPR4的表达水平)+(0.082×CA9的表达水平)‑(0.043×IGLL3P的表达水平)+(0.081×SYCP2的表达水平)+(0.084×SMIM22的表达水平)+(0.011×GBE1的表达水平)+(0.015×ALDOC的表达水平)+(0.014×ZNF813的表达水平)；所述模型能够准确的预测三阴乳腺癌复发风险。

技术领域

本发明属于预后评估技术领域，尤其涉及一组用于三阴乳腺癌预后评估的基因集、试剂盒及其应用。

背景技术

三阴乳腺癌(TNBC)是乳腺癌的一种特殊亚型，具有侵袭性强，预后差的特点。目前临床上以化疗为主，各种靶向治疗和免疫治疗新方法正在临床试验中。但是肿瘤复发、转移等问题一直存在。

TNBC复发严重威胁患者的健康和生命，肿瘤免疫在TNBC复发和进展过程中发挥重要功能。临床上，医生往往希望通过风险预测模型，更加精准的评估患者疾病复发或预后生存情况，识别出复发风险高、预后差的特定人群，实现疾病的严密监测和早期的适宜治疗。

但是，目前尚没有针对三阴乳腺癌的准确的预后风险预测模型。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一组免疫细胞浸润相关的三阴乳腺癌预后评估的基因集，能够准确的预测三阴乳腺癌复发风险和免疫治疗疗效，为临床上形成全面而详实的TNBC治疗体系提供一定的思路。

本发明提供了一组用于三阴乳腺癌预后风险评估的基因集，所述基因集包括PLPPR4、CA9、IGLL3P、SYCP2、SMIM22、GBE1、ALDOC和ZNF813基因。

本发明提供了检测所述的基因集中基因表达水平的试剂在制备三阴乳腺癌预后评估产品中的应用。

本发明提供了一种用于三阴乳腺癌预后风险评估的试剂盒，包括检测所述的基因集中基因表达水平的试剂和预后风险评分模型。

优选的，所述预后风险评分模型如下：

RiskScore＝(0.201×PLPPR4的表达水平)+(0.082×CA9的表达水平)-(0.043×IGLL3P的表达水平)+(0.081×SYCP2的表达水平)+(0.084×SMI M22的表达水平)+(0.011×GBE1的表达水平)+(0.015×ALDOC的表达水平)+(0.014×ZNF813的表达水平)。

本发明提供了所述的试剂盒在制备三阴乳腺癌患者总体生存情况诊断或辅助诊断产品中的应用。

与现有技术相比，本发明具有如下有益效果：本发明提供的免疫细胞浸润相关的三阴乳腺癌预后评估的基因集，能够准确的预测三阴乳腺癌复发风险和免疫治疗疗效，为临床上形成全面而详实的TNBC治疗体系提供一定的思路。本发明提供的基因集构建的三阴性乳腺癌预后风险评分模型预测效果良好：Kaplan-meier生存曲线显示高风险分数是患者的复发风险因素(P＜0.001)；ROC分析显示模型复发预后具有较高特异性和敏感性；预后风险热图显示风险分数越高，患者复发风险越高。

附图说明

图1为训练集GSE21653中样本的免疫分型；其中(A)为CDF曲线(k＝2to10)；(B)为CDF曲线线下面积(k＝2to10)；(C)为一致性聚类分为2个亚型C1和C2；

图2为训练集GSE21653中免疫相关共表达基因模块，其中(A-B)为不同软阈值的网络拓扑分析；(C)为基因聚类图；(D)共表达基因模块与免疫特征的相关性；