[发明专利]一种基于多任务学习的分子性能预测方法及系统在审
申请号: | 202211167723.1 | 申请日: | 2022-09-23 |
公开(公告)号: | CN115565613A | 公开(公告)日: | 2023-01-03 |
发明(设计)人: | 谭筝;李颜;史卫梅;杨仕清 | 申请(专利权)人: | 成都职业技术学院 |
主分类号: | G16C10/00 | 分类号: | G16C10/00;G16C20/70;G16C20/90;G16C60/00;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 | 代理人: | 周浩杰 |
地址: | 610095 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 任务 学习 分子 性能 预测 方法 系统 | ||
1.一种基于多任务学习的分子性能预测方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,分子特征向量抽取,以及基准回归器选取;
S2,样本内一阶模型训练,及元变量生成;
S3,样本内二阶模型训练;
S4,样本外一阶模型预测;
S5,样本外二阶模型预测;
S6,确定预测评价指标;
S7,对基于图像学习的多任务堆叠模型,将元变量在池化过程后水平连接到图神经网络GNN的分子向量,用于表示扩展的分子特征空间;
S8,多层堆叠的多任务模型衍生。
2.根据权利要求1所述的基于多任务学习的分子性能预测方法,其特征在于,在步骤S1中,所述分子特征向量包括ECFP分子圆形指纹、CM库伦指纹和基于经验的分子描述符;所述分子描述符包括拓扑、几何、电子和物化描述符;
对于图像网络模型,所述分子特征向量指通过图像卷积,或者注意力机制操作,并经过池化层汇集过后的特征向量,该特征向量在模型中为可学习变量,能够在其上堆叠预测目标值。
所述基准回归器包括机器学习回归模型,所述机器学习回归模型包括树模型、支持向量机、深度神经网络和图像网络。
3.根据权利要求1所述的基于多任务学习的分子性能预测方法,其特征在于,在步骤S2中,包括子步骤:
S21,设一共有p个分子性能,则基于特征向量Xtrain和p个目标(Y1…Yp),分配p个独立的单任务模型进行训练,得到模型(Model1…Modelp);
S22,通过样本内训练的模型对p个分子性能进行预测,得到p个预测的目标并将这p个预测目标值作为元变量。
4.根据权利要求1所述的基于多任务学习的分子性能预测方法,其特征在于,在步骤S3中,包括子步骤:
将p个元变量堆叠到分子特征向量上,形成转换后的特征向量并针对p个目标(Y1…Yp),进行二阶模型训练,最终得到p个二阶模型(Model1'…Modelp')。
5.根据权利要求1所述的基于多任务学习的分子性能预测方法,其特征在于,在步骤S4中,包括子步骤:
输入样本外的特征向量Xq,使用p个一阶模型(Model1…Modelp),对p个分子性能进行预测,得到p个性能预测值
6.根据权利要求1所述的基于多任务学习的分子性能预测方法,其特征在于,在步骤S5中,包括子步骤:
将p个性能预测值堆叠到Xq上,形成转换后的样本外特征向量使用p个二阶模型(Model1'…Modelp')进行预测,最终得到p个预测性能
7.根据权利要求1所述的基于多任务学习的分子性能预测方法,其特征在于,在步骤S6中,包括子步骤:使用R2和RRMSE作为单任务模型的指标。
8.根据权利要求1所述的基于多任务学习的分子性能预测方法,其特征在于,在步骤S7中,对基于图像学习的多任务堆叠模型,输入为原子即节点级特征空间,元变量即目标估计将在池化过程后水平连接到图神经网络GNN的分子向量,以表示扩展的分子特征空间。
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