[发明专利]因果参数的确定方法、装置、设备以及存储介质在审
申请号: | 202211115933.6 | 申请日: | 2022-09-14 |
公开(公告)号: | CN115662510A | 公开(公告)日: | 2023-01-31 |
发明(设计)人: | 柳一君;孙骥;孙慧妍;常毅 | 申请(专利权)人: | 吉林大学 |
主分类号: | G16B20/50 | 分类号: | G16B20/50;G16B20/30;G16B25/10;G16B40/00 |
代理公司: | 北京恒博知识产权代理有限公司 11528 | 代理人: | 张晓芳 |
地址: | 130012 吉*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 因果 参数 确定 方法 装置 设备 以及 存储 介质 | ||
1.一种因果参数的确定方法,其特征在于,所述方法包括:
对多个生物组织的基因表达数据进行处理,得到所述多个生物组织变为目标状态的参考生物过程活性数据,所述多个生物组织均携带目标基因且处于所述目标状态;
对所述多个生物组织的体细胞突变数据、所述多个生物组织的第一类混杂因子数据以及所述参考生物过程活性数据进行编码,得到所述多个生物组织的第二类混杂因子数据,所述第一类混杂因子数据和所述第二类混杂因子数据具有不同的可观测性;
对所述多个生物组织的第二类混杂因子数据进行解码,得到所述多个生物组织变为所述目标状态的目标生物过程活性数据;
基于所述目标生物过程活性数据,确定所述目标基因与所述目标状态之间的因果参数,所述因果参数用于表示所述目标基因发生突变导致生物组织处于所述目标状态的可能性。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述对多个生物组织的基因表达数据进行处理,得到所述多个生物组织变为目标状态的参考生物过程活性数据包括:
基于所述多个生物组织的基因表达数据,确定所述多个生物组织中多个基因之间的相关性;
基于所述多个生物组织中多个基因之间的相关性,从所述多个基因中确定所述多个生物组织的核心基因;
对所述多个生物组织的核心基因的基因表达数据对所述多个生物组织的核心基因的平均表达向量进行回归,得到所述多个生物组织变为所述目标状态的参考生物过程活性数据。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述多个生物组织的基因表达数据,确定所述多个生物组织中多个基因之间的相关性包括:
从所述多个生物组织的基因表达数据中获取所述多个基因分别对应的多个基因表达向量;
基于所述多个基因表达向量之间的相关性,确定所述多个生物组织中多个基因之间的相关性。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述基于所述多个生物组织中多个基因之间的相关性,从所述多个基因中确定所述多个生物组织的核心基因包括:
基于所述多个生物组织中多个基因之间的相关性,确定所述多个基因中各个基因与其他基因之间的全局相关性;
基于所述多个基因中各个基因与其他基因之间的全局相关性,从所述多个基因中确定所述多个生物组织的核心基因。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述基于所述多个生物组织中多个基因之间的相关性,确定所述多个基因中各个基因与其他基因之间的全局相关性包括:
对于所述多个基因中的任一基因,将所述基因与所述多个基因中其他基因之间的相关性与对应的显著性进行融合,得到所述基因与其他基因之间的目标相关性;
将所述基因与其他基因之间的目标相关性进行加权求和,得到所述基因与其他基因之间的全局相关性。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述基于所述多个基因中各个基因与其他基因之间的全局相关性,从所述多个基因中确定所述多个生物组织的核心基因包括:
按照全局相关性从大至小的顺序对所述多个基因进行排序;
将所述多个基因中前目标数量个基因确定为所述多个生物组织的核心基因。
7.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述对所述多个生物组织的核心基因的基因表达数据进行回归,得到所述多个生物组织变为所述目标状态的参考生物过程活性数据包括:
确定所述多个生物组织的核心基因的表达向量在所述多个生物组织上的平均表达向量上的回归系数,所述平均表达向量是所述核心基因在所述多个生物组织上的基因表达向量的平均值;
将所述回归系数确定为所述多个生物组织变为所述目标状态的参考生物过程活性数据。
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