[发明专利]肠道菌群在诊断转甲状腺素蛋白淀粉样变性中的应用

说明书

本发明公开了肠道菌群在诊断转甲状腺素蛋白淀粉样变性中的应用，所述肠道菌群包括Candidatus Stoquefichus massiliensis、Parabacteroides sp.HGS0025、Clostridium gasigenes或Parabacteroides sp.Marseille‑P3160的一种或几种。本发明首次发现了所述肠道菌群在转甲状腺素蛋白心脏淀粉样变中呈现显著性上调，进一步研究发现所述肠道菌群在诊断转甲状腺素蛋白心脏淀粉样变中具有较高的敏感性和特异性，具有较高的诊断效能。

技术领域

本发明属于生物医药领域，具体涉及肠道菌群在诊断转甲状腺素蛋白淀粉样变性中的应用。

背景技术

淀粉样变性是由遗传、变性和感染等不同因素引起的，因蛋白质分子折叠异常所致的淀粉样物质在各组织和脏器细胞外间隙沉积，从而破坏细胞和器官功能的一种进行性疾病。淀粉样变主要累及心、肝、肾、脾、胃肠、肌肉、皮肤、神经系统等部位。转甲状腺素蛋白淀粉样变性(transthyretin amyloidosis，ATTR)是一种以转甲状腺素蛋白(transthyretin，TTR)为沉积物的淀粉样变性，根据有无TTR基因突变，ATTR分为突变型(ATTRm)和野生型(wild-type TTR，ATTRwt)。ATTRm是一种常染色体显性遗传病，目前已发现超过120个致病的TTR基因突变位点，ATTRm发病率仅为0.87/100,000，截至2016年全球患病人数仅为38468人，是一种罕见病，已入选我国第一批罕见病目录。目前人们对ATTR的认识程度较低，且局限在大型医院里，大部分基层医生都不认识，其流行病学状况、发病情况也尚不清楚。ATTR早期缺乏特异性临床表现，这为诊断带来很大的挑战，导致该病的诊断率较低，误诊率较高。

人体的生理健康除受自身基因的调控外，还受到肠道菌群的影响。人体肠道内的细菌有1000-1150种，其中160种为优势菌种，存在不同类型的生态学相互作用。肠道细菌的300多万个基因被视为人类的“第二基因组”，在正常人体健康状态下，肠道微生物种群处于平衡状态，而在宿主患病期，菌群失调或紊乱。

研究肠道菌群与转甲状腺素蛋白淀粉样变性之间的相关性，探究其在转甲状腺素蛋白淀粉样变性发生发展过程中的作用，对于加深转甲状腺素蛋白淀粉样变性的认识及实现转甲状腺素蛋白淀粉样变性的诊断和治疗具有重要意义。

发明内容

为弥补现有技术的不足，本发明提供了一种转甲状腺素蛋白淀粉样变性的肠道菌群标志物，能够实现对转甲状腺素蛋白淀粉样变性的早期诊断。

为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

本发明的第一方面提供了一种转甲状腺素蛋白淀粉样变性的肠道菌群标志物，所述肠道菌群标志物包括Candidatus Stoquefichus massiliensis、Parabacteroidessp.HGS0025、Clostridium gasigenes或Parabacteroides sp.Marseille-P3160的一种或几种。

本发明的第二方面提供了检测本发明第一方面所述的肠道菌群标志物丰度的试剂在制备诊断转甲状腺素蛋白淀粉样变性的产品中的应用。

进一步，所述试剂包括检测所述肠道菌群标志物的特异性的引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。

本发明的第三方面提供了一种诊断转甲状腺素蛋白淀粉样变性的产品，所述产品包括检测本发明第一方面所述的肠道菌群标志物丰度的试剂。

进一步，所述试剂包括检测所述肠道菌群标志物的特异性的引物、探针、反义寡核苷酸、适配体或抗体。

进一步，所述产品包括试剂盒、芯片。

进一步，所述产品包括提取微生物基因组DNA、微生物蛋白、菌体成分的试剂。