[发明专利]基于机器学习的细胞外囊泡分类方法、装置、设备及介质在审
申请号: | 202210699761.5 | 申请日: | 2022-06-20 |
公开(公告)号: | CN114973245A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 龙菲;韩顶立;冉瑞;钟晓翠;王炼炼;陈竺;杨洋 | 申请(专利权)人: | 重庆医科大学 |
主分类号: | G06V20/69 | 分类号: | G06V20/69;G06V10/764;G06V10/774;G06N20/00 |
代理公司: | 重庆渝之知识产权代理有限公司 50249 | 代理人: | 郑小龙 |
地址: | 400016*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 机器 学习 细胞 外囊泡 分类 方法 装置 设备 介质 | ||
本发明公开了一种基于机器学习的细胞外囊泡分类方法,包括:获取样品的第一参数;设定筛选条件,判断所述第一参数是否满足所述筛选条件,并根据所述筛选条件从所述样品中筛选出细胞外囊泡;获取所述细胞外囊泡的第二参数;将所述第二参数输入至预先训练的基于机器学习的分类模型,以通过所述分类模型完成对所述细胞外囊泡的分类。本发明基于机器学习的分类方法,能够从复杂的生物标志物信息发现难以识别的规律。本发明基于机器学习,利用代谢物丰度对细胞外囊泡进行决策并分类,评估基于特征筛选后的模型对卵巢癌EVs代谢物的预测潜力,以期协助临床诊断及卵巢癌早期筛查。
技术领域
本发明属于深度学习技术领域,具体涉及一种基于机器学习的细胞外囊泡分类方法、装置、设备及介质。
背景技术
根据WHO2020统计,卵巢癌(Ovarian cancer,OV)是全世界女性死亡人数仅次于宫颈癌的第二大妇科恶性肿瘤,导致约20.72万妇女死亡。由于缺乏早期症状和有效的早期筛查方法,使5年生存率从93%降低到20%,因此被称为“沉默的杀手”。细胞外囊泡(Extracellular vesicles,EVs)是近年来癌症诊断的潜力标志物,具有双层膜结构,通常按大小和来源分为粒径约50nm-150nm的外泌体和100nm-1mm的微泡,研究发现其携带的源细胞遗传和分子信息与肿瘤分期及预后相关,甚至可以用于早期诊断。近些年来,代谢组学通过色谱质谱联用技术鉴定样品中的所有代谢小分子,已经被广泛应用于诊断卵巢癌的研究中,但早期鉴别的相关研究没有提及。
发明内容
鉴于以上所述现有技术的缺点,本发明提供一种基于机器学习的细胞外囊泡分类方法、装置、设备及介质,以解决现有技术中的至少一个缺陷。
为实现上述目的及其他相关目的,本发明提供一种基于机器学习的细胞外囊泡分类方法,包括:
获取样品的第一参数;
基于所述第一参数从所述样品中筛选出细胞外囊泡;
获取所述细胞外囊泡的第二参数;
将所述第二参数输入至预先训练的基于机器学习的分类模型,以通过所述分类模型完成对所述细胞外囊泡的分类。
于本发明一实施例中,通过透射电子显微镜拍摄所述样品的超微形态结构;
通过纳米颗粒跟踪分析仪检测所述样品的粒径范围;
通过化学发光成像分析所述样品的TSG101蛋白条带;
所述第一参数包括超微形态结构、粒径范围和TSG101蛋白条带。
于本发明一实施例中,所述筛选条件包括:
是否呈现椭圆形的膜结构;
粒径大小是否为50-500nm;
是否具有TSG101蛋白条带。
于本发明一实施例中,所述获取所述细胞外囊泡的第二参数,包括:
获取所述细胞外囊泡的总离子流图,所述总离子流图包含各细胞外囊泡样本的物质信息;
对所述总离子流图进行解析,得到所述细胞外囊泡的代谢物数据;
从多种代谢物中筛选出目标代谢物,并获取目标代谢物的代谢物丰度以作为所述第二参数。
于本发明一实施例中,在利用预先训练的基于机器学习的分类模型对细胞外囊泡分类前,还包括:
获取细胞外囊泡的代谢物丰度;
对所述代谢物丰度进行校正,得到校正数据;
对所述校正数据进行降维;
利用降维后的数据构建训练分类模型的训练集;
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