[发明专利]一种基于改进U-Net的肝脏肿瘤分割方法在审
| 申请号: | 202210630566.7 | 申请日: | 2022-06-06 |
| 公开(公告)号: | CN114998265A | 公开(公告)日: | 2022-09-02 |
| 发明(设计)人: | 李秀华;朱水成;王士奇 | 申请(专利权)人: | 长春工业大学 |
| 主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T5/00;G06T7/11;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 130012 吉林*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 基于 改进 net 肝脏 肿瘤 分割 方法 | ||
1.一种基于改进U-Net的肝脏肿瘤分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一:获取腹部CT数据集,并对数据集进行预处理;
步骤二:基于Pytorch深度学习框架搭建用于肝脏肿瘤分割的网络模型,在U-Net基础上进行改进,具体变化为:
在编码阶段使用混合空洞卷积替换原有卷积块,在解码阶段使用密集上采样卷积替换原始上采样,使用残差模块替换普通卷积块,在每个跳跃连接之间加入注意力机制;
步骤三:将预处理后的数据输入到基于改进U-Net的肝脏肿瘤分割网络中进行训练,得到最佳的网络模型;
步骤四:使用训练好的网络模型对经过预处理之后的待预测肝脏肿瘤CT图像进行分割,获取肝脏分割结果图和肿瘤分割结果图。
2.根据权利要求1所述的一种基于改进U-Net的肝脏肿瘤分割方法,其特征在于,所述步骤一中的具体过程如下:
1)步骤一中所述的数据集来自于MICCAI2017LiTS挑战数据集,包括来自7个临床机构的131名患者的增强腹部CT影像,由经验丰富的放射科医生对肝肿瘤进行标注,LiTS是用于肝脏肿瘤分割的常用数据集,包含3D CT图像和对应的真实的分割掩码;
2)将数据集中的CT图像和对应的标签图像分为训练集、验证集和测试集;
3)对数据集图像进行去噪处理;设定阈值,将CT图像中灰度值在阈值之外的部分截断掉;对肝脏CT图像沿Z轴进行切片处理,切片后的CT图片像素大小为512×512。
3.根据权利要求1所述的一种基于改进U-Net的肝脏肿瘤分割方法,其特征在于,所述步骤二中的具体过程如下:
1)构建的网络模型使用3次下采样和3次上采样,保留原始的U形对称结构;
2)在U-Net编码阶段使用混合空洞卷积替换原有卷积块,空洞率分别为1、2、3,卷积核大小为3,激活函数为ReLU,混合空洞卷积能够增大感受野、获取更多的上下文信息,同时能够避免空洞卷积产生的网格效应;在解码阶段使用密集上采样卷积替换原有上采样,捕获和解码更详细的信息;使用残差模块替换普通卷积块,加速模型的训练并防止网络退化;在每个跳跃连接之间加入注意力机制(CBAM),CBAM能够使模型捕捉通道维度和空间维度上的重要特征信息,重点关注感兴趣区域,抑制冗余特征;在网络中添加若干dropout层来减轻过拟合现象,泛化整个训练模型。
4.根据权利要求1所述的一种基于改进U-Net的肝脏肿瘤分割方法,其特征在于,所述步骤三中的具体过程如下:
1)在网络中输入训练集和验证集,使用训练集进行基于Pytorch搭建好的网络模型的训练,开始基于改进U-Net的肝脏分割网络和肝肿瘤分割网络的训练;通过前向传播对网络模型进行训练,然后通过softmax分类器输出预测的概率图,并选择损失函数;根据所述损失函数得到的计算误差,进行反向传播,更新网络模型中参数的值;重复上述过程直到损失函数值收敛到设定范围;对得到的网络模型进行验证,得到最佳的网络模型;
2)模型训练时使用Focal Tversky损失函数(FTL)用以解决肝脏肿瘤分割中的类不平衡问题;
3)验证集用于网络模型在训练过程中的验证工作,当找到合适的学习轮次之后,即网络收敛时提前结束训练,保存训练好的网络模型参数。
5.根据权利要求1所述的一种基于改进U-Net的肝脏肿瘤分割方法,其特征在于,所述步骤四中的具体过程如下:
1)使用训练好的肝脏分割网络模型对测试集进行分割,得到最终的肝脏分割结果图;
2)使用训练好的肝肿瘤分割网络模型对测试集进行分割,得到最终的肿瘤分割结果图。
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