[发明专利]一种生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法

权利要求书

1.一种生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法，其特征在于：所述方法包括：

S1，根据相关词条筛选文献中基因信息文本词，获取基因分子互作关系对，构建文献数据库；

S2，基于文献数据库中的基因分子互作关系对，采用权重算法计算目标检索因子与经典力学敏感通路的相关性；

S3，将目标检索因子与经典力学敏感通路之间的相关性进行可视化展示，并将经典力学敏感通路中的基因分子显示为互相连接的节点，通过单击节点之间的连线可以链接到文献数据库中相应的文献；

所述步骤S2中权重算法的公式为：

式中，为基因g与经典力学敏感通路p的相关系数，表示经典力学敏感通路p中第i个基因在文献数据库中相关实体总数，为经典力学敏感通路p所有基因在文献数据库中相关实体的总数，、分别表示基因g和经典力学敏感通路p的集合。

2.根据权利要求1所述的生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法，其特征在于：所述步骤S1与步骤S2之间，还包括对PMC数据库进行深度神经网络训练，筛选带生物信息的文本关键词，构建语料库。

3.根据权利要求2所述的生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法，其特征在于：所述生物信息包括力学类型、研究物种、细胞类型。

4.根据权利要求1或2所述的生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法，其特征在于：所述步骤S1中相关词条包括生物力学、骨相关词条。

5.根据权利要求4所述的生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法，其特征在于：所述步骤S1包括对基因信息文本词进行计算机语言归一化和预处理。

6.根据权利要求5所述的生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法，其特征在于：所述步骤S1还包括采用PubTator识别基因信息文本词，并通过调用NCBI基因数据库的API将基因信息文本词转换为正式名称。

7.根据权利要求1所述的生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法，其特征在于：所述经典力学敏感通路包括Hippo、BMP、TGFβ、Wnt、Notch、PI3K/Akt、MAPK、Ras中的至少一种。

8.根据权利要求1所述的生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法，其特征在于：所述步骤S3中，还包括可视化展示目标检索因子在KEGG数据库中的通路信息。

9.根据权利要求1或8所述的生物力学调控骨改建文本挖掘交互网站构建方法，其特征在于：所述步骤S3中，还包括可视化展示目标检索因子在String数据中的基因分子互作关系对。