[发明专利]一种结直肠癌化疗药物敏感性预测标志物探针及应用

说明书

本发明属于基因检测技术领域，具体公开了一种结直肠癌化疗药物敏感性预测标志物探针，包括用于检测PHLPP1和PHLPP2的PHLPP探针，用于检测PHLPP1的探针核苷酸序列为SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.8中的一个或两个以上；用于检测PHLPP2的探针核苷酸序列为SEQ ID NO.9至SEQ IDNO.16中的一个或两个以上。本发明还公开了上述探针用于检测结直肠癌化疗药物敏感性预测标志物的检测方法，以及上述探针及其检测方法在制备检测试剂盒中的应用。本发明公开的探针能够通过检测外周血CTC中PHLPP mRNA水平以预测患者对奥沙利铂、5‑氟尿嘧啶、卡培他滨等化疗药物的敏感性，以及识别不同表型外周血CTC中PHLPP mRNA表达水平。

技术领域

本发明属于基因检测技术领域，尤其涉及一种结直肠癌化疗药物敏感性预测标志物探针及应用。

背景技术

结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)是威胁人类健康的主要恶性肿瘤之一，2020年全球癌症数据显示，CRC发病率占全球所有癌症的10.0％，死亡率占癌症死亡总数的9.4％；在中国，CRC的新发病人数仅次于肺癌，成为第二大癌症。流行病学数据显示，近年来，我国CRC的发病率和死亡率均呈上升趋势。CRC临床表现主要为排便习惯的改变，腹痛，贫血和肠出血。但大多数病人早期无明显症状，导致CRC病人初诊时多为中晚期。

目前针对中晚期无法手术切除和不适合使用免疫治疗的CRC患者的治疗方式仍然以化疗为主。最新NCCN(美国国立综合癌症网络)更新的2021第二版(V2)肠癌指南仍然推荐使用FOLFOX(奥沙利铂(Oxaliplatin)+亚叶酸钙+5-氟尿嘧啶(5-Fluorouracil，5-FU))或CAPEOX(奥沙利铂+卡培他滨)作为主要的辅助治疗手段。

近年来，以循环肿瘤细胞(circulating tumor cell，CTC)分型检测为代表的液体活检技术是肿瘤研究领域的一个新兴方向，在肿瘤患者早期诊断、分期、疗效监测、预测评估方面均显示出较好的应用价值。大部分中晚期CRC患者在接受化疗后会复发，5年生存率低于15％，而化疗耐药是导致患者预后差和复发的主要原因。

现有的技术手段主要通过组织活检或血液样本对某些与肿瘤药物相关的基因(例如TS基因、MTHFR基因等)进行检测来预测患者对化疗药物敏感性，然而组织活检取样难度大且不能反复多次取样，因而不利于动态评估耐药情况；而通过外周血浆或血清进行药物基因检测，主要检测的是肿瘤细胞坏死后释放的片段化DNA，不能真实地反应肿瘤的实际情况。

PHLPP磷酸酶家族有PHLPP1和PHLPP2两种亚型，属于丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶的PPM超家族。在最初发现PHLPP作为AKT的蛋白磷酸酶之后，许多研究证明PHLPP通过抑制多种致癌信号通路从而抑制结直肠癌的发生和发展。申请人之前的研究(Cell Death andDisease(2021)12:960；https://doi.org/10.1038/s41419-021-04251-0)发现：PHLPP下调是造成结直肠癌化疗耐药的重要原因，并探明了PHLPP引起结直肠癌耐药的机制，说明PHLPP可充当结直肠癌化疗药物敏感性预测的标志物，但目前临床上并没有可行的试剂盒和相应的检测手段检测PHLPP mRNA的表达。

发明内容

本发明的目的在于提供结直肠癌化疗药物敏感性预测标志物探针及应用，以解决上述技术问题。

本发明目的之一在于提供：一种结直肠癌化疗药物敏感性预测标志物探针，包括用于检测PHLPP1和PHLPP2的PHLPP探针，用于检测PHLPP1的探针核苷酸序列为SEQ ID NO.1至SEQ ID NO.8中的一个或两个以上；用于检测PHLPP2的探针核苷酸序列为SEQ ID NO.9至SEQ ID NO.16中的一个或两个以上。