[发明专利]一种用于鉴定高山美利奴羊断奶重的SNP标记及其应用

说明书

本发明属于分子遗传学技术领域，具体涉及一种用于鉴定高山美利奴羊断奶重的SNP标记及其应用，所述的SNP分子标记位于国际绵羊参考基因组Oar_v4.0版本第23号染色体上第3566034个核苷酸位点C/T突变。本发明还涉及利用PCR技术检测上述SNP分子标记的特异性引物对和含有该引物对的试剂盒及核苷酸多态性检测方法，与传统检测法相比，该技术具有准确性高，检测速度快，成本低，结果容易判断等优点。将SNP位点检测用于开展高山美利奴羊断奶重早期选择，缩短培育周期、加快培育进程，建立一种高山美利奴羊断奶重早期选择技术，减少高山美利奴羊断奶重优良性状的育种时间，降低育种成本，具有很高的应用价值。

技术领域

本发明属于分子遗传学技术领域，具体涉及一种用于鉴定高山美利奴羊断奶重的SNP标记及其应用。

背景技术

对于种畜而言，繁殖力就是生产力，繁殖性能直接关系到畜牧产业的经济效应。羊的繁殖性能主要包括总产羔数、产活羔数、初生重、初生窝重、断奶重等指标。羊出生时的体重即羊初生重，是衡量羊的一个重要数量性状，影响羊的生长发育、生产性能和胴体等级等。初生重与断奶成活率、断奶重、出栏重也呈正相关，与出栏日龄呈负相关。而且初生重低的羊，大多生长发育不良。因此有针对性的提高羊初生重，可使得羊有更高的成活率和更优良的生产性能，进而为生产者带来更大的经济效益。

断奶重是衡量羊生产性能的重要指标，出生羊断奶重和其出栏日龄以及日增重显著相关，随着断奶重的增加，日增重增加、出栏日龄下降。而且断奶重是一个复杂的数量性状，由多基因共同调控，且受到品种、胎次、营养及环境等诸多因素的影响。传统的育种方法多采用传统表型选育技术，即根据后代表型信息推断亲本生产力，选育周期长，遗传进展缓慢。采用分子标记辅助选择进行选育，其优势在于不易受其他外界环境等因素的影响，可缩短育种时间，提高选育的准确性。SNP是1996年由美国麻省理工学院的人类基因组研究中心学者Lander提出的一类分子遗传标记，主要是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP表现出的多态性仅涉及到单个碱基的变异，表现是有转换、颠换、插入和缺失等。SNP分子标记具有遗传稳定、突变率低、便于自动化检测等优点。因此，寻找与产羔性状紧密连锁的分子辅助标记基因，筛选调控产羔性状的功能基因，是实现现代分子育种技术与常规育种技术有机结合，提高繁殖效率的有益手段。

本发明发现了一种影响高山美利奴羊断奶重性状的SNP分子标记，国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第23号染色体上第3566034位点的碱基处，突变碱基为C或T；所述SNP分子标记碱基为C时，基因型为CC或CT；当所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为TT；所述基因型CC和基因型CT的高山美利奴羊断奶重显著大于TT基因型(p0.05)，CC和CT基因型个体间并未表现出显著差异(p0.05)。本发明提供的利用PCR技术检测与高山美利奴羊断奶重相关的核苷酸多态性的方法，该技术准确性高，检测速度快，成本低廉，并且结果判读更容易。利用本方法可对断奶重相关的SNP位点多态性实现自动化检测，通过对高山美利奴羊断奶重性状相关的SNP位点进行检测，可用于育种早期选留，将CC和CT基因型个体保留下来，提高高山美利奴羊选育准确性，在对高山美利奴羊进行大规模分子精准育种中具有潜在的应用价值。

发明内容

本发明提供了一种影响高山美利奴羊断奶重的SNP分子标记，并通过检测所述SNP分子标记碱基类型，实现高山美利奴羊断奶重的基因分型，所述SNP分子标记碱基为C时，基因型为CC或CT；所述SNP分子标记碱基为T时，基因型为TT；所述基因型CC或CT的高山美利奴羊断奶重显著大于基因型TT(p0.05)，通过基因分型分析高山美利奴羊断奶重，进行选育育种。具体包括以下内容：

第一方面，本发明提供了一种检测与高山美利奴羊断奶重相关的SNP分子标记的试剂在检测高山美利奴羊断奶重中的应用，所述SNP分子标记位于国际绵羊基因组Oar_v4.0版本第23号染色体上第3566034位点的碱基处；突变碱基为C或T。