[发明专利]一种差异化富集小片段核酸分子的方法在审

专利信息
申请号: 202210372920.0 申请日: 2022-04-07
公开(公告)号: CN114958825A 公开(公告)日: 2022-08-30
发明(设计)人: 宋东亮;李明;孙晓亮 申请(专利权)人: 翌圣生物科技(上海)股份有限公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12Q1/6806
代理公司: 苏州根号专利代理事务所(普通合伙) 32276 代理人: 朱华庆
地址: 200120 上海市浦*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 种差 异化 富集 片段 核酸 分子 方法
【权利要求书】:

1.一种差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于:裂解后的样品在低乙醇浓度下与第一磁珠结合,分离上清液和第一磁珠,上清液在高乙醇浓度下与第二磁珠结合,保留第二磁珠并洗脱,得到小片段核酸分子,其中低乙醇浓度是指反应体系中乙醇浓度为5%-20%V/V,高乙醇浓度是指反应体系中乙醇浓度为21%-35%V/V。

2.如权利要求1所述的差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于其步骤包括:

(1)样本裂解:在血浆样本中加入蛋白酶K和裂解液,进行裂解反应;

(2)大片段核酸分子的吸附:向裂解产物中加入结合液、乙醇和第一磁珠,进行吸附反应,所述第一磁珠为硅基磁珠,其中乙醇的加入量为使反应体系中乙醇浓度控制在5%-20%;

(3)分离第一磁珠和上清液:将步骤(2)获得的反应体系置于磁力架上,分离第一磁珠和上清液;

(4)小片段核酸分子的吸附:向上清液中加入乙醇和第二磁珠,使反应体系中乙醇浓度为21%-35%,进行吸附反应,所述第二磁珠为硅基磁珠;

(5)分离第二磁珠和上清液:将步骤(4)获得的反应体系置于磁力架上,分离第二磁珠和上清液;

(6)小片段核酸分子的回收:将第二磁珠置于洗脱液中,进行洗脱反应,然后分离磁珠和洗脱液,回收洗脱液,得到富集的小片段核酸分子。

3.如权利要求2所述的差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于:在进行小片段核酸分子的回收之前,先对分离的第二磁珠进行洗涤。

4.如权利要求2所述的差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于:步骤(1)中蛋白酶K:样品:裂解液的比例为40μL:1mL:125μL,反应过程为60℃孵育20min。

5.如权利要求4所述的差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于:步骤(2)中裂解产物:结合液:第一磁珠的比例为1165μL:600μL:20μL,反应过程为室温颠倒混匀10min。

6.如权利要求5所述的差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于:步骤(4)中第二磁珠的加入量与第一磁珠的加入量基本相同,反应过程为室温颠倒混匀10min。

7.如权利要求6所述的差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于:步骤(6)中第二磁珠:洗脱液的比例为20μL:50μL,反应过程为涡旋混匀10min。

8.如权利要求3所述的差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于:所述对分离的第二磁珠进行洗涤具体为:在第二磁珠内加入洗涤液,涡旋混匀2min,在磁力架上分离第二磁珠和洗涤液。

9.如权利要求2所述的差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于:所述裂解液包含1-3M盐酸胍,0.2%-1%m/V的NP-40,0.2%-1.5%m/V的SDS。

10.如权利要求2所述的差异化富集小片段核酸分子的方法,其特征在于:所述结合液包含3-6M盐酸胍和/或硫氰酸胍,0.2%-5%m/V的Triton X-100,0.2%-2%m/V的N-月桂酰肌氨酸钠,0.2%-5%m/V的NP-40。

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