[发明专利]抑制非必需高丰度蛋白表达以提高TG酶发酵水平的方法在审
申请号: | 202210265587.3 | 申请日: | 2022-03-17 |
公开(公告)号: | CN115029290A | 公开(公告)日: | 2022-09-09 |
发明(设计)人: | 白林泉;吴邦昊;王丹;步建国 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学;泰兴市东圣生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N1/21 | 分类号: | C12N1/21;C12N15/76;C12N15/113;C12N9/10;C12R1/465 |
代理公司: | 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 | 代理人: | 胡晶 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 抑制 必需 高丰度 蛋白 表达 提高 tg 发酵 水平 方法 | ||
1.一种TG酶高产菌株,其特征在于,所述菌株的非必需高丰度蛋白编码基因转录被抑制。
2.如权利要求1所述的TG酶高产菌株,其特征在于,在茂源链霉菌IPIO中通过CRISPRi技术分别降低了基因SMDS_5177、SMDS_758、SMDS_5989、SMDS_6427的转录水平。
3.一种用于降低蛋白编码基因转录水平的整合型质粒载体,其特征在于,所述载体分别抑制了茂源链霉菌IPIO的谷氨酰胺转氨酶激活金属蛋白酶抑制蛋白编码基因SMDS_5177、短杆菌肽合酶C亚基蛋白编码基因SMDS_758、苦霉素合酶模块3和4蛋白编码基因SMDS_5989、促自溶诱导蛋白编码基因SMDS_6427的转录水平,含有靶向以上4个基因启动子区域的gRNA,通过降低基因转录水平抑制蛋白表达。
4.根据权利要求3所述的整合型质粒载体,其特征在于,所述基因SMDS_5177的序列如SEQ ID NO.1所示,其对应的gRNASMDS_5177的序列如SEQ ID NO.2所示;所述SMDS_758的序列如SEQ ID NO.3所示,其对应的gRNASMDS_5989的序列如SEQ ID NO.4所示;所述基因SMDS_5989的序列如SEQ ID NO.5所示,其对应的gRNASMDS_5989的序列如SEQ ID NO.6所示;所述基因SMDS_6427的序列如SEQ ID NO.7所示,其对应的gRNASMDS_6427的序列如SEQ ID NO.8所示。
5.一种根据权利要求3或4所述的整合型质粒载体的构建方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
在CRISPy-web网站上设计特异性靶向SMDS_5177启动子区域的gRNA,通过PCR扩增得到含sgRNASMDS_5177基因序列的PCR片段,通过Gibson连接的方法连入整合型质粒pSET-dCas9-actII4-NT-S1中的SpeI/EcoRI位点,获得整合型质粒载体pLQ2103;
或,在CRISPy-web网站上设计特异性靶向SMDS_758启动子区域的gRNA,通过PCR扩增得到含sgRNASMDS_758基因序列的PCR片段,通过Gibson连接的方法连入整合型质粒pSET-dCas9-actII4-NT-S1中的SpeI/EcoRI位点,获得整合型质粒载体pLQ2104;
或,在CRISPy-web网站上设计特异性靶向SMDS_5989启动子区域的gRNA,通过PCR扩增得到含sgRNASMDS_5989基因序列的PCR片段,通过Gibson连接的方法连入整合型质粒pSET-dCas9-actII4-NT-S1中的SpeI/EcoRI位点,获得整合型质粒载体pLQ2105;
或,在CRISPy-web网站上设计特异性靶向SMDS_6427启动子区域的gRNA,通过PCR扩增得到含sgRNASMDS_6427基因序列的PCR片段,通过Gibson连接的方法连入整合型质粒pSET-dCas9-actII4-NT-S1中的SpeI/EcoRI位点,获得整合型质粒载体pLQ2106。
6.一种高产谷氨酰胺转氨酶的茂源链霉菌菌株,其特征在于,将如权利要求3或4所述的整合型质粒载体,或如权利要求5所述的方法构建得到的整合型质粒载体,通过接合转移分别导入受体菌茂源链霉菌IPIO中进行位点特异性重组,获得所述菌株。
7.一种提高谷氨酰胺转氨酶产量的方法,其特征在于,分别通过CRISPRi技术降低茂源链霉菌中SMDS_5177、SMDS_758、SMDS_5989、SMDS_6427的转录水平。
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