[发明专利]面向自动扫描的组织病理切片检测目标定位方法与装置在审
申请号: | 202210185218.3 | 申请日: | 2022-02-28 |
公开(公告)号: | CN114494465A | 公开(公告)日: | 2022-05-13 |
发明(设计)人: | 张从鹏;张文;刘扬 | 申请(专利权)人: | 北京毅能博科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/80 | 分类号: | G06T7/80;G06T7/00;G06V10/25;G06V30/14 |
代理公司: | 北京汇捷知识产权代理事务所(普通合伙) 11531 | 代理人: | 崔建章 |
地址: | 100176 北京市大兴区北京经济技术开发区科创十四街99*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 面向 自动 扫描 组织 病理 切片 检测 目标 定位 方法 装置 | ||
1.一种面向自动扫描的组织病理切片检测目标定位方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、开启相机初始化相机参数之后,进行图像采集,结合形态学预处理定位玻片标签OCR矩形区域;
S2、判定矩形区域的中心点坐标是否位于左半区象限,若是则对图像扭转180度,若否则进入步骤S3;
S3、获得矩形区域Phi角度,Phi的输出范围为[-pi,pi];
S4、根据矩形区域的中心点坐标以及区域Phi角度,对该区域进行仿射变换对图像进行定位矫正,以矩形区域右下角点O为原点,水平为X、垂直为Y建立直角坐标系;
S5、由得到的矩形区域扩展向上建立另一个矩形ROI截取整个玻片区域,以该矩形ROI在相机采集的灰度图上抠图截取,获得玻片全区域图像;
S6、对该图像进行图像增强处理,获得组织玻片的标签信息;
S7、依据标签区域与病理区域的相对位置建立病理ROI,并在玻片全区域抠图,获得病理全区域;
S8、对于病理全区域应用数学形态学提取出若干目标检测区域,按行排序之后,获得目标检测区域最小外接矩形的角点坐标信息;
S9、根据角点坐标信息与玻片全区域原点坐标计算出所有目标检测区域的X、Y偏移像素距离;
S10、结合实际相机标定的坐标系转换实现由图像坐标系转换为世界坐标系,将像素偏移距离(Pix)换算为实际偏移距离(mm),坐标变换关系式如公式(1)所示:
其中,深度s为目标点在相机坐标系Z方向的值,等号左侧的矩阵为图像坐标系中的坐标,等号右侧第一个矩阵为相机内参数矩阵,第二个矩阵为相机外参数矩阵,第三个矩阵为相机坐标系中的坐标;
S11、结合该组织病理玻片的标签信息对应好目标检测区域的位置信息保存在数据库中。
2.根据权利要求1所述的面向自动扫描的组织病理切片检测目标定位方法,其特征在于,步骤S1中形态学预处理采用二值阈值处理方法。
3.根据权利要求1所述的面向自动扫描的组织病理切片检测目标定位方法,其特征在于,步骤S6中获得组织玻片的标签信息方法为:经过阈值化和形态学特征选取获得OCR连通域,对OCR连通域进行OCR光学字符识别或者二维码解码处理。
4.根据权利要求1所述的面向自动扫描的组织病理切片检测目标定位方法,其特征在于,步骤S10中坐标变换流程采用顺序变换:先从图像坐标系到相机坐标系,使用内参变换,之后从相机坐标系到世界坐标系,使用外参变换。
5.根据权利要求4所述的面向自动扫描的组织病理切片检测目标定位方法,其特征在于,从图像坐标系到相机坐标系获得的相机坐标为非齐次,转换为齐次坐标再进行下一步变换。
6.根据权利要求4所述的面向自动扫描的组织病理切片检测目标定位方法,其特征在于,从相机坐标系到世界坐标系时,将外参矩阵转换为齐次再进行计算。
7.根据权利要求4所述的面向自动扫描的组织病理切片检测目标定位方法,其特征在于,内参变换公式为:
其中,等号左边为相机坐标系中的点坐标,等号右边第一项为图像坐标系到相机坐标系的变换矩阵,第二项为图像坐标系中的像点坐标,第三项为图像的位深。
8.根据权利要求4所述的面向自动扫描的组织病理切片检测目标定位方法,其特征在于,外参变换公式为:
其中,等号左侧表示为世界坐标系上的点坐标,等号右侧第一项为相机坐标系到世界坐标系的变换矩阵,第二项为相机坐标系上的点坐标。
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