[发明专利]用于鉴别九华黄精的叶绿体基因组及其在九华黄精鉴别中的应用在审
| 申请号: | 202210171035.6 | 申请日: | 2022-02-23 |
| 公开(公告)号: | CN114480714A | 公开(公告)日: | 2022-05-13 |
| 发明(设计)人: | 孙松;龙子江;吴存林;乔学芹 | 申请(专利权)人: | 合肥仟金草生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6869;C12N15/11;G06K9/62;G16B40/00 |
| 代理公司: | 合肥律众知识产权代理有限公司 34147 | 代理人: | 赵娟 |
| 地址: | 230000 安徽省合肥市高新区香樟大道168*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 用于 鉴别 黄精 叶绿体 基因组 及其 中的 应用 | ||
1.用于鉴别九华黄精的叶绿体基因组,其特征在于,包括九华黄精叶绿体基因组中的4个具有特定功能并具有高度特异性的基因,分别为rpoB、ycf4、ndhF、trnI-GAU,其核苷酸序列依次为SEQ ID NO.1~4所示。
2.权利要求1所述的用于鉴别九华黄精的叶绿体基因组在鉴别九华黄精中的应用。
3.一种九华黄精鉴别方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1,采集新鲜待测九华黄精样本叶片,提取样品总DNA;
步骤2,以SEQ ID NO.1~4高变区的基因组序列,采用SEQ ID NO.5~12对应的引物进行PCR扩增,并进行电泳检测,若扩增长度与设计目的片段一致且仅有一条带,则PCR扩增成功;
步骤3,将PCR产物基于MGISEQ2000平台进行双向测序;
步骤4,将得到的SEQ ID NO.1~4高变区基因序列,按rpoB、ycf4、ndhF、trnI-GAU顺序拼接,并与权利要求1所述的叶绿体基因组进行对齐、校对;
步骤5,利用校对后的序列构建NJ/ML/Bayes树,若与权利要求1所述的叶绿体基因组序列聚为一支且支持率大于80,则确定其为九华黄精。
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