[发明专利]一种与国兰花期相关的SSR分子标记引物及其应用

说明书

本发明公开了一种与国兰花期相关的SSR分子标记引物及其应用。该SSR分子标记引物包括10对SSR引物序列。利用上述SSR引物扩增获得的SSR分子标记可用于国兰种质资源开花时间的鉴定。本发明检测方法在短时间内即可完成不同季节开花的国兰品种鉴定，具有省时、高效、低成本、操作简便等优势，可应用于国兰种质资源或品种的开花时间鉴定及分子辅助育种，对于国兰花期改良育种具有广泛应用价值。

技术领域

本发明涉及分子标记及其检测技术领域，具体涉及一种与国兰花期相关的SSR分子标记引物及其应用。

背景技术

兰科植物拥有高度特化的花器官和丰富的生物多样性，是珍贵的园艺观赏花卉。全世界约有736属28000种(Chase et al.,2015)，按生态习性可分为地生兰、气生兰、腐生兰三大类。其中兰属地生种大多原产中国，因此又称国兰，已有800多年的栽培历史，被列为中国十大名花之一，主要包括建兰、墨兰、春兰、蕙兰、莲瓣兰、豆瓣兰、寒兰和春剑等8大种类。

其中仅有建兰花期较长，植株从每年6月至11月可多次开花，其余7大类国兰每年均只开一次花，难以满足市场常年需求。因此通过中间杂交，选择可开花期跨度大，可一年多次开花的杂交后代，对国兰产业发展具有重要意义。

随着分子生物学技术的发展，基于DNA多态性的分子标记技术逐渐成为生物基因分型、遗传多样性分析、品种鉴定以及分子辅助育种的重要工具。在遗传多样性分析中，传统的分子标记主要有RFLP、RAPD、AFLP、ISSR、SSR等。得益于高通量测序技术的迅速发展，SSR标记因其在基因组、转录组中分布宽泛，具有多态性丰富，操作便利，共显性且高度可重复性等优点，已被广泛应用于植物种质资源鉴定和分子辅助育种。然而目前国兰育种仍以传统杂交育种为主，从种子萌发到出瓶移栽需要2-3年时间，随后种苗通常需要经历3年以上童期才能正常开花，因此子代开花性状需经历5-6年时间，育种成本高，周期长，且性状难以预测。本发明提供一种与国兰开花性状相关的SSR荧光标记及其应用，针对当前国兰花期改良的育种过程中，表型鉴定周期长、成本高、易受生长季节和环境影响等一系列问题，提供与国兰花期相关SSR引物并利用这些引物对国兰不同品种进行鉴定，能快速区分不同花期品种。

发明内容

本发明旨在针对现有技术的技术缺陷，提供一种与国兰花期相关的SSR分子标记引物及其应用。

本发明的第一个目的是提供一种与国兰花期相关的SSR分子标记引物，其包括以下10对SSR引物序列：

SSR_23084_c0_g1 F：5'-TTGTTTGCTACAGGTCAGCG-3'

R：5'-TCAGGATGCCTGAAAAATCA-3'

SSR_21692_c0_g1 F：5'-TTCTTTAATGCCATCTCGGC-3'

R：5'-CGCCAACTGGAGTTCTCTTC-3'

SSR_54963_c2_g1 F：5'-ATCGTGCGCAAAATCTCTCT-3'

R：5'-CAGTCACCATCTCCCTCACA-3'

SSR_40348_c2_g1 F：5'-TGCTAAACGATGAAGCATGG-3'

R：5'-GCGCAGTTGCTATTCTACGA-3'

SSR_44302_c3_g1 F：5'-TCAATAAGTCGAGATGCTCCAT-3'

R：5'-CACGAGACAAAATGCTTCCC-3'

SSR_45085_c2_g1 F：5'-TTGATTTCTTTAACAAAATGATGC-3'