[发明专利]hsa_circ_0006420环状RNA及其在胶质瘤诊断、预后评估中的应用

说明书

本发明公开了一种hsa_circ_0006420环状RNA及其在胶质瘤诊断、预后评估中的应用，属于癌症诊断领域。hsa_circ_0006420环状RNA的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明得到一个新的hsa_circ_0006420环状RNA基因，胶质瘤肿瘤组织以及患者血液样本中的hsa_circ_0006420环状RNA表达显著升高，可应用于胶质瘤诊断、替莫唑胺治疗后响应以及患者生存期预测。

技术领域

本发明属于癌症诊断技术领域，具体涉及一种hsa_circ_0006420环状RNA及其在胶质瘤诊断、预后评估中的应用。

背景技术

脑胶质瘤是成年人最为频发的脑肿瘤疾病，占颅内肿瘤的40.49％。从确诊开始，脑胶质瘤患者平均生存寿命不超过五年。目前而言胶质瘤的诊断和治疗方法虽处于不断改进阶段，但是胶质瘤患者生存率并没有明显提高。胶质瘤诊断仍然处于以临床、病理学和影像学信息为基础的经验性阶段，而且一经诊断，绝大多数均为中晚期，手术后的生存率不容乐观。因此，寻找胶质瘤早期诊断标志物对患者进行“早发现，早治疗”，以及提高胶质瘤患者的生存期，并相应地选择合理的后续治疗方案，是神经科学领域亟待解决的研究任务。

CircRNA是近年来发现的非编码RNA家族重要成员，其形成没有极性和聚腺苷酸尾的环化结构，由于circRNA分子呈封闭环状结构，具有更高的核酸酶稳定性，不受RNA外切酶影响，不易降解，这使得它们成为临床应用新型生物标记具有很大的优势。高通量测序和生物信息学方法揭示了circRNA在真核生物中广泛表达。研究发现大多数circRNA参与一些肿瘤的发生发展，在病理条件下以组织特异性异常表达。研究发现circRNA在肿瘤发生发展中发挥关键作用，其作用机制上主要包括方面：(1)circRNA作为miRNA的吸附物(sponge)，通过吸附miRNA调控其靶基因和下游通路的表达，进而影响胶质瘤的发生发展；(2)circRNA通过翻译成肽段或者蛋白发挥作用；(3)通过结合母基因(host gene)DNA序列介导母基因mRNA的转录调控，这些特性使得circRNA成为肿瘤诊断和治疗的重要靶点和潜在标志物。

发明内容

本发明针对现有胶质瘤诊断的缺陷，提供一种用于胶质瘤诊断和预后评估的新靶标，即hsa_circ_0006420环状RNA基因，并提供该靶标的新应用，特别是在其检测试剂、胶质瘤诊断、肿瘤药物对胶质瘤的治疗效果以及胶质瘤预后评估中的应用。

本发明通过以下技术方案实现：

第一方面，本发明提供一种hsa_circ_0006420环状RNA基因，其核苷酸序列如SEQID NO.1所示。

hsa_circ_0006420环状RNA分子是由AEBP2基因的第2和3号外显子首位相接连接而成的环状RNA分子(AEBP2基因全长79,021nt，共由9个外显子组成。hsa_circ_0006420环状RNA全长序列为：

CATAAGCAGTACTATAATGGATGTAGACAGCACAATTTCCAGTGGGCGTTCAACTCCAGCAATGATGAATGGACAAGGAAGCACTACTTCTTCAAGCAAAAATATTGCCTATAATTGTTGTTGGGACCAGTGCCAGGCTTGCTTCAACTCTAGCCCAGATCTGGCAGATCACATCCGTTCCATACATGTAGATGGTCAGCGAGGAGGGGTATTTGTTTGCTTATGGAAAGGTTGTAAAGTATATAACACTCCATCTACCAGTCAAAGTTGGTTACAAAGGCATATGCTGACACACAGTGGAGACAAACCTTTCAAG(SEQ ID NO.1)

第二方面，本发明提供一种用于检测hsa_circ_0006420环状RNA基因的检测引物，所述检测引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2～3所示，所述检测引物可用于制备胶质瘤诊断或预后评估试剂盒。