[发明专利]一种遗传早发主动脉夹层风险基因筛查panel及筛查方法在审
申请号: | 202210010170.2 | 申请日: | 2022-01-06 |
公开(公告)号: | CN114350783A | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 孟平;李亚雄;张雅永;字云峰;杨俊 | 申请(专利权)人: | 昆明市延安医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6874 |
代理公司: | 昆明合盛知识产权代理事务所(普通合伙) 53210 | 代理人: | 牛林涛 |
地址: | 650000 云南*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 遗传 主动脉 夹层 风险 基因 panel 方法 | ||
1.一种遗传早发主动脉夹层风险基因筛查panel,其特征在于,包括以下遗传早发主动脉夹层风险基因:
TGFBR1、TGFBR2、TGFB3、SMAD3、ACTA2、MYH11、MYLK、PRKG1。
2.根据权利要求1所述一种遗传早发主动脉夹层风险基因筛查panel的设计方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:利用SureDesign二代测序软件捕获完成内置步骤,设计富含TGFBR1、TGFBR2、TGFB3、SMAD3、ACTA2、MYH11、MYLK、PRKG1目的基因的panel;
S2:设计panel包含:探针分子对靶向DNA捕获,通过以上探针进行多重连接依赖性探针扩增所检测的片段,因突变位置较为集中,采用外显子作为以上基因的目标区域,测序深度为500X;
S3:目的基因片段两端设计60bp探针序列,合并后去冗余,探针间的挪动大小为3bp;
S4:采用原位合成技术,探针两端添加固定的扩增序列,合成DNA单链,通过PCR进一步扩增;
S5:扩增后的单链DNA转录为RNA,添加生物素标记得到具有生物标记探针的芯片,即得到主动脉夹层早发基因检测panel。
3.一种遗传早发主动脉夹层风险基因筛查方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:从EDTA抗凝血中提取待测病人外周血DNA样本,样本量利用Nano DNA、RNA、蛋白定量仪进行浓度检测,DNA浓度大于3微克;
S2:使用SeqCap EZ外显子文库v2.0试剂盒富集外显子和邻近的剪接位点序列,构建该病人或正常人的基因组文库,利用panel检测夹层患病的早发基因捕获;
S3:采用测序仪进行高通量测序,在100bp测序方案运行测序程序,分别对配对样本进行基因检测,通过分析比较,选择突变频率≥5%的基因区域,得到疾病相关的所有突变信息。
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