[发明专利]用于多重PCR二代测序的引物组合、试剂盒及建库方法在审
申请号: | 202111657981.3 | 申请日: | 2021-12-30 |
公开(公告)号: | CN114657239A | 公开(公告)日: | 2022-06-24 |
发明(设计)人: | 伍建;姬晓雯;庞博 | 申请(专利权)人: | 迈基诺(重庆)基因科技有限责任公司 |
主分类号: | C12Q1/6876 | 分类号: | C12Q1/6876;C12Q1/6869;C12Q1/6806;C12N15/11;C40B50/06 |
代理公司: | 北京星通盈泰知识产权代理有限公司 11952 | 代理人: | 葛战波 |
地址: | 400026 重庆市江北区港城东环路6*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 多重 pcr 二代 引物 组合 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于多重PCR的二代测序的引物组合,其特征在于,包括:如SEQ ID NO:1-SEQID NO:806所示核苷酸序列。
2.一种用于多重PCR的二代测序的试剂盒,其特征在于,包括:用于第一步PCR扩增试剂盒和用于第二步PCR扩增试剂盒;
所述用于第一步PCR扩增试剂盒包括:Platinum Multiplex PCR Master Mix 2×、GCEnhancer和权利要求1所述引物组合;
所述用于第二步PCR扩增试剂盒包括:2×KAPA HiFi Hotstart Ready Mix、PE1.0和Barcode。
3.一种用于多重PCR的二代测序的扩增体系,其特征在于,包括第一步PCR扩增体系和第二步PCR扩增体系;
所述第一步PCR扩增体系包括:25体积份的Platinum Multiplex PCR Master Mix 2×、5体积份的GC Enhancer、15体积份的权利要求1所述引物组合和5体积份的DNA样本;
所述第二步PCR扩增体系包括:25体积份的2×KAPA HiFi Hotstart Ready Mix、1体积份的PE1.0、1体积份的Barcode和23体积份的第一步PCR扩增纯化产物。
4.一种基于多重PCR的二代测序的建库方法,其特征在于,包括:
1)、提取样本DNA;
2)、基于提取的样本DNA,配置权利要求3中所述第一步PCR扩增体系,进行第一步PCR扩增并纯化,
3)、基于第一步PCR扩增并纯化后的纯化产物进行第二次PCR扩增并纯化;
4)、对第二次PCR扩增并纯化后的纯化产物进行电泳鉴定后进行测序分析。
5.如权利要求4所述基于多重PCR的二代测序的建库方法,其特征在于,所述第一步PCR扩增的条件为:98℃、3分钟,循环一次;96℃、45秒,80℃、30秒,54℃、3分钟,68℃、30秒,循环45次。
6.如权利要求4所述基于多重PCR的二代测序的建库方法,其特征在于,所述第二次PCR扩增的条件为:98℃、3分钟,循环一次;98℃、20秒,65℃、30秒,72℃、20秒,循环15次;68℃保持10分钟。
7.如权利要求4所述基于多重PCR的二代测序的建库方法,其特征在于,所述电泳鉴定的条带长度在100-200bp之间。
8.如权利要求4所述基于多重PCR的二代测序的建库方法,其特征在于,所述测序分析采用HiSeq2000测序平台进行测序,上靶率高于98%,平均深度深于985×,98.9%的位点测序深度在10×以上。
9.如权利要求4所述基于多重PCR的二代测序的建库方法,其特征在于,所述样本DNA来源于外周静脉血、组织或鼻咽拭子样本。
10.权利要求1所述用于多重PCR的二代测序的引物组合或权利要求2所述用于多重PCR的二代测序的试剂盒在制备多重PCR二代测序试剂中的应用。
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