[发明专利]一种基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒及其应用在审
申请号: | 202111597538.1 | 申请日: | 2021-12-24 |
公开(公告)号: | CN115386635A | 公开(公告)日: | 2022-11-25 |
发明(设计)人: | 吴俊杰;孙振宇;蒋庚西;冯键;王一;郭士成;李玉涛;邹子修 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 上海德昭知识产权代理有限公司 31204 | 代理人: | 程宗德 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 gkn1 基因 rs425453 检测 试剂盒 及其 应用 | ||
本发明提供了一种基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒,用于检测癌症患者的GKN1基因rs425453位点的基因型,具有这样的特征,包括:用于对癌症患者的全血基因组进行PCR的引物组,该引物组包括第一上游引物和第一下游引物,其中,第一上游引物的核苷酸序列如序列表中SEQ NO:1所示,第一下游引物的核苷酸序列如序列表中SEQ NO:2所示。
技术领域
本发明属于癌症研究领域,具体涉及一种基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒及其应用。
背景技术
肺癌是世界上最常见的癌症和导致癌症死亡的主要原因。随着外科治疗、免疫治疗、放化疗和分子靶向治疗在肺癌治疗方面取得的显著成就,肺癌的治疗虽然得到了很大进步,但我国肺癌患者5年生存率仍20%。肺癌患者的预后受多种环境因素干扰,预测难度较大。因此,寻找有效的预测预后标志物对于预测肺癌患者预后、针对肺癌患者进行个体化治疗和提高肺癌患者5年生存率至关重要。大量研究证据表明,肺癌的发生发展受环境和个体遗传等多种因素共同影响。基因多态性是人体最常见的基因变异,已被证明可以影响基因表达并预测包括肺癌在内的多种癌症患者的预后。
发明内容
本发明是为了解决上述问题而进行的,目的在于提供一种基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒及其应用。
本发明提供了一种基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒,用于检测癌症患者的GKN1基因rs425453位点的基因型,具有这样的特征,包括:用于对癌症患者的全血基因组进行PCR的引物组,该引物组包括第一上游引物和第一下游引物,其中,第一上游引物的核苷酸序列如序列表中SEQ NO:1所示,第一下游引物的核苷酸序列如序列表中SEQNO:2所示。
在本发明提供的基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒中,还可以具有这样的特征:其中,基因型为CC基因型、CT基因型以及TT基因型中的任意一种。
在本发明提供的基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒中,还可以具有这样的特征,还包括:5’通用探针、3’通用探针、位点识别序列、qPCR通用引物、5’特异连接探针以及3’特异连接探针。
在本发明提供的基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒中,还可以具有这样的特征:其中,癌症为肺癌。
在本发明提供的基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒中,还可以具有这样的特征:其中,肺癌为非小细胞肺癌。
本发明提供了一种基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒在预测肺癌患者预后生存中的应用。
发明的作用与效果
根据本发明所涉及的基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒,因为该试剂盒包括引物组,该引物组包括第一上游引物和第一下游引物,通过该引物组能够对癌症患者的全血基因组进行PCR扩增,并根据扩增结果判断癌症患者的GKN1基因rs425453位点的基因型,根据该基因型的分型结果可以对癌患者预后生存进行预测。
附图说明
图1是本发明的实施例2中基因分型检测的过程示意图。
具体实施方式
为了使本发明实现的技术手段、创作特征、达成目的与功效易于明白了解,以下实施例结合附图对本发明一种基于GKN1基因rs425453位点的基因分型检测试剂盒及其应用作具体阐述。
以下实施例中所使用的Qiagen Blood DNA Extraction Kit(Qiagen,Hilden,Germany)、Cell Counting Kit-8、AnnexinV-FITC细胞凋亡检测试剂盒均为市售试剂盒。
实施例1
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