[发明专利]一种药物筛选方法、装置、计算机设备及可读存储介质

权利要求书

1.一种药物筛选方法，其特征在于，包括：

获取靶标蛋白的动力学信息，所述动力学信息可反映所述靶标蛋白的活化过程难易；

基于预设公式，计算药物分子结合对所述动力学信息的影响，筛选符合预期的药物分子。

2.根据权利要求1所述的药物筛选方法，其特征在于，所述获取靶标蛋白的动力学信息，包括：

基于所述靶标蛋白的结构，获得所述靶标蛋白在两种不同的结构状态之间连续变化的构象变化轨迹；

从所述构象变化轨迹中提取关键构象，计算所述关键构象的动力学数据，形成所述动力学信息。

3.根据权利要求2所述的药物筛选方法，其特征在于，所述基于所述靶标蛋白的结构，获得所述靶标蛋白在两种不同的结构状态之间连续变化的构象变化轨迹，包括：

为所述靶标蛋白的结构进行建模；

确定所述靶标蛋白的两种结构状态分别为起始构象和终点构象；

使用计算生物学方法获得所述靶标蛋白在所述起始构象和所述终点构象状态之间连续变化的构象变化轨迹；

优选地，所述靶标蛋白的结构从公共数据库获取，或使用预测工具预测，或通过实验测定。

4.根据权利要求3所述的药物筛选方法，其特征在于，所述从所述构象变化轨迹中提取关键构象，计算所述关键构象的动力学数据，形成所述动力学信息，包括：

使用计算生物学方法获得所述构象变化轨迹中每个构象对应的自由能；

从所述构象变化轨迹中提取关键构象，根据所述关键构象的自由能数据形成所述动力学信息。

5.根据权利要求4所述的药物筛选方法，其特征在于，所述动力学信息包括能垒，所述从所述构象变化轨迹中提取关键构象，根据所述关键构象的自由能数据形成所述动力学信息，包括：

从所述构象变化轨迹中提取起始构象和过渡态构象作为关键构象，所述过渡态构象为自由能最高的构象，所述能垒为所述过渡态构象对应的自由能减所述起始构象对应的自由能；或，

从所述构象变化轨迹中提取自由能上升幅度最大的两个构象作为关键构象，所述能垒为所述自由能上升幅度最大的两个构象对应的自由能之差；

优选地，所述靶标蛋白活化过程包括一个或多个步骤，其中每一个步骤分别具有能垒，选择能垒最大的步骤为所述靶标蛋白活化过程的决速步骤。

6.根据权利要求5所述的药物筛选方法，其特征在于，所述基于预设公式，计算药物分子结合对所述动力学信息的影响，筛选符合预期的药物分子，包括：

获得所述靶标蛋白的第一能垒，所述第一能垒为所述靶标蛋白结合药物分子前的活化过程中的最大能垒；

获得所述靶标蛋白的第二能垒，所述第二能垒为所述靶标蛋白结合药物分子后的活化过程中的最大能垒；

根据所述第一能垒和所述第二能垒的差值来筛选所述药物分子。

7.根据权利要求6所述的药物筛选方法，其特征在于，所述基于预设公式，计算药物分子结合对所述动力学信息的影响，筛选符合预期的药物分子，包括：

在所述靶标蛋白上确定药物分子结合的活性口袋；

对所述靶标蛋白的关键构象的同一活性口袋进行药物分子对接，分别获得所述关键构象的结合自由能；

根据所述关键构象的结合自由能得到所述第一能垒和所述第二能垒的差值。

8.一种药物筛选装置，其特征在于，所述装置包括：

信息获取模块，用于获取靶标蛋白的动力学信息，所述动力学信息可反映所述靶标蛋白的活化过程难易；

信息处理模块，用于基于预设公式，计算药物分子结合对所述动力学信息的影响，筛选符合预期的药物分子。

9.一种计算机设备，其特征在于，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，所述计算机程序在所述处理器上运行时执行权利要求1至7任一项所述的药物筛选方法。

10.一种可读存储介质，其特征在于，其存储有计算机程序，所述计算机程序在处理器上运行时执行权利要求1至7任一项所述的药物筛选方法。