[发明专利]一种构建植物发育分子调控网络的方法及其应用在审

专利信息
申请号: 202111486035.7 申请日: 2021-12-07
公开(公告)号: CN113963745A 公开(公告)日: 2022-01-21
发明(设计)人: 李英;高志民 申请(专利权)人: 国际竹藤中心
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B20/20
代理公司: 北京高沃律师事务所 11569 代理人: 吴波
地址: 100102 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 构建 植物 发育 分子 调控 网络 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种构建植物发育分子调控网络的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

对植物组织基因文库进行测序得到miRNAs-靶基因对;

利用双荧光素酶报告检测技术验证所述miRNAs-靶基因对,然后通过荧光原位杂交技术对所述miRNAs-靶基因对在植物组织细胞中作用位置进行定位后即可获得所述的植物发育分子调控网络。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述测序包括转录组测序、小RNA测序和降解组测序。

3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述转录组测序包括:

对植物组织基因文库进行测序、数据分析、筛选得到不同植物组织发育时期差异表达的基因。

4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述小RNA测序包括:

对植物组织基因文库进行测序、数据分析、筛选得到植物相邻发育时期差异表达的miRNAs,并预测所述miRNAs的靶基因。

5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述降解组测序包括:

对植物组织基因文库进行测序,将测序得到的cluster Tags与Rfam数据库进行比对获得未被注释的序列,然后对所述未被注释的序列进行分析获得降解位点,经分析筛选得到所述miRNAs-靶基因对。

6.根据权利要求1或权利要求2-5任意一项所述的方法,其特征在于,所述植物组织基因文库为根据植物组织RNA构建所得的cDNA文库。

7.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述验证包括如下步骤:

利用双荧光素酶检测所述的miRNAs-靶基因对,得到检测结果为阳性的miRNA-靶基因对。

8.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述定位包括如下步骤:

将所述检测结果为阳性的miRNA-靶基因对进行荧光原位杂交,观察miRNA与靶基因是否两两都能够定位在样本的同一组织。

9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,根据所述miRNA与靶基因的定位位置,运用cytoscape软件绘制即可得到可视化的所述植物发育分子调控网络。

10.权利要求1-9任意一项所述的方法或利用该方法构建得到的分子调控网络在指导分子育种中的应用。

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