[发明专利]用于胃癌筛查的标志物、探针组合物及其应用在审
| 申请号： | 202111406204.1 | 申请日： | 2021-11-24 |
| 公开（公告）号： | CN114317740A | 公开（公告）日： | 2022-04-12 |
| 发明（设计）人： | 王小奇;杨亚东;李永君;吴宁宁;郭媛媛;关晋霞 | 申请（专利权）人： | 博尔诚（北京）科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京彩和律师事务所 11688 | 代理人： | 闫桑田;刘磊 |
| 地址： | 100176 北京市大兴区北京*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 用于 胃癌 标志 探针 组合 及其 应用 | ||
1.一种用于检测胃癌的标志物，所述标志物选自下述中的一种：C1orf70、RNF220、MIR137HG、RPS23P10、GYPC、ZEB2、ITGA9、CD200、GHR、ZNF354C、ELOVL2、EYA4、FSCN1、ELMO1、AEBP1、ADHFE1、FRMD4A、SNX32、FLI1、CACNA1C、ST8SIA1、ITGA5、CLDN10、FGF14、RP11-578F21.12、FAM7A3、FBN1、UBE2Q2、EFTUD1、TM6SF1、PRKCB、GSG1L、C17orf46、LOC100133991、SEPT9、TSHZ3、ZFP82、ZNF568、ZNF582、ZNF132、OLIG1、CABIN1和PHF21B。
2.根据权利要求1所述的标志物，其中，所述标志物的核苷酸序列选自如SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:47所示的一种，优选所述标志物为甲基化后的标志物。
3.一种探针组合物，所述探针组合物包含靶向权利要求1或2所述标志物甲基化的探针。
4.根据权利要求3所述的探针组合物，其中，所述探针组合物包含高甲基化的第一探针组合物和低甲基化的第二探针组合物，所述第一探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域杂交，所述第二探针组合物用于与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域杂交；
优选的，所述第一探针组合物包括n个探针，所述n个探针与经重亚硫酸盐转化的CG高甲基化的区域的正义链和反义链的每个核苷酸杂交；
优选的，所述第二探针组合物包括m个探针，所述m个探针与经重亚硫酸盐转化的CG低甲基化的区域的正义链和反义链的每个核苷酸杂交；
优选的，n和m均是1-10中的任意整数；
优选的，第n-1个探针和第n个探针之间有x1个核苷酸重叠，优选的，x1为0-100中的任意整数；
优选的，第m-1个探针和第m个探针之间有x2个核苷酸重叠，优选的，x2为0-100中的任意整数；
进一步优选的，所述第一探针组合物包括如SEQ ID NO:48-141中的一种或两种，所述第二探针组合物包括如SEQ ID NO:142-235中的一种或两种。
5.标志物在制备用于检测胃癌的试剂盒中的用途，所述标志物选自下述中的一种：C1orf70、RNF220、MIR137HG、RPS23P10、GYPC、ZEB2、ITGA9、CD200、GHR、ZNF354C、ELOVL2、EYA4、FSCN1、ELMO1、AEBP1、ADHFE1、FRMD4A、SNX32、FLI1、CACNA1C、ST8SIA1、ITGA5、CLDN10、FGF14、RP11-578F21.12、FAM7A3、FBN1、UBE2Q2、EFTUD1、TM6SF1、PRKCB、GSG1L、C17orf46、LOC100133991、SEPT9、TSHZ3、ZFP82、ZNF568、ZNF582、ZNF132、OLIG1、CABIN1和PHF21B。
6.根据权利要求5所述的用途，其中，所述标志物的核苷酸序列选自如SEQ ID NO:1-47所示的一种，优选所述标志物为甲基化后的标志物；
优选的，所述探针组合物用于靶向胃癌的甲基化后的标志物；
优选的，所述探针组合物为权利要求3或4所述的探针组合物。
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