[发明专利]一种与IV型烟草蔗糖酯基因qBMVSE485紧密连锁的共显性SSR标记及其应用有效

专利信息
申请号: 202111363676.3 申请日: 2021-11-17
公开(公告)号: CN113980976B 公开(公告)日: 2023-08-08
发明(设计)人: 童治军;肖炳光;方敦煌;李勇;陈学军;曾建敏;冯智宇;焦芳婵 申请(专利权)人: 云南省烟草农业科学研究院
主分类号: C12N15/29 分类号: C12N15/29;C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 成都市鼎宏恒业知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 51248 代理人: 张勋
地址: 650000*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 一种 iv 烟草 蔗糖 基因 qbmvse485 紧密 连锁 显性 ssr 标记 及其 应用
【权利要求书】:

1.一组与IV型烟草蔗糖酯基因qBMVSE485紧密连锁的共显性SSR标记,其特征在于,所述的与IV型烟草蔗糖酯基因qBMVSE485紧密连锁的共显性SSR标记的编号为TM50931和TM56908、TMc44058和TMc44049,其PCR扩增产物核苷酸序列分别为SEQ ID No.1和SEQ IDNo.2、SEQ ID No.3和SEQ ID No.4、SEQ ID No.5和SEQ ID No.6、SEQ ID No.7和SEQ IDNo.8所示;

所述的SSR标记所对应的4个位点的引物序列分别为:

TM50931序列为:

TM50931F:5’- AAAAACCCGAGATAAACCGATA -3’( SEQ ID NO.9),

TM50931R:5’- AGCAAGGTGGTCAAGTTTACA -3’( SEQ ID NO.10);

TM56908序列为:

TM56908F:5’- TGTGACAGGACAAGGTTCCA -3’(SEQ ID NO.11),

TM56908R:5’- GTTGGCATCTCATAGCGACA -3’( SEQ ID NO.12);

TMc44058序列为:

TMc44058F:5’- AACAGCAGCCCAGTTCACTT -3’( SEQ ID NO.13),

TMc44058R:5’- TGAGTGCTTGACCCGTATTG -3’( SEQ ID NO.14);

TMc44049序列为:

TMc44049F:5’- GTTTACCTTCGGGTCCGTTT -3’(SEQ ID NO.15),

TMc44049R:5’- GGACCCACATCGATATCTGC -3’( SEQ ID NO.16)。

2.如权利要求1所述的SSR标记组合的应用,其特征在于,用于检测烟草基因组DNA中是否存在IV型烟草蔗糖酯基因qBMVSE485

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,该应用的方法为,以TM50931和TM56908序列的引物、TMc44058和TMc44049序列的引物分别扩增待检测烟草基因组DNA,检测PCR扩增产物。

4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,PCR扩增产物中同时含有如SEQ ID No.1、SEQ ID No.3、SEQ ID No.5和SEQ ID No.7所示序列则表明该待测烟草植株含有高香气品质的IV型烟草蔗糖酯的纯合等位基因。

5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,PCR扩增产物中同时含有如SEQ ID No.1和SEQ ID No.3所示序列则表明该待测烟草植株含有高香气品质的IV型烟草蔗糖酯的纯合等位基因。

6.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,PCR扩增产物中同时含有如SEQ ID No.5和SEQ ID No.7所示序列则表明该待测烟草植株含有高香气品质的IV型烟草蔗糖酯的纯合等位基因。

7.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,PCR扩增产物中同时含有如SEQ ID No.2、SEQ ID No.4、SEQ ID No.6和SEQ ID No.8所示序列则为待测烟草植株不含或含有痕量的IV型烟草蔗糖酯的纯合等位基因。

8.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,PCR扩增产物中排除以下结果,即为含有IV型烟草蔗糖酯的杂合等位基因;所述的结果为:1)同时含有如SEQ ID No.1、SEQ ID No.3、SEQ ID No.5和SEQ ID No.7所示序列;2)同时含有如SEQ ID No.1和SEQ ID No.3所示序列;3)同时含有如SEQ ID No.5和SEQ ID No.7所示序列;4)同时含有如SEQ ID No.2、SEQID No.4、SEQ ID No.6和SEQ ID No.8所示序列。

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