[发明专利]一种用于检测噪音相关性耳聋基因的探针组及其试剂盒在审
申请号: | 202111337378.7 | 申请日: | 2021-11-12 |
公开(公告)号: | CN113943795A | 公开(公告)日: | 2022-01-18 |
发明(设计)人: | 查定军;梁鹏飞;范贝;王淑娟;李琼;李薇 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军空军军医大学 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 西安汇恩知识产权代理事务所(普通合伙) 61244 | 代理人: | 张伟花 |
地址: | 710032 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 噪音 相关性 耳聋 基因 探针 及其 试剂盒 | ||
1.一种用于检测噪音相关性耳聋基因的探针组,其特征在于,所述探针组包括能够同时特异性捕获以下52个噪音相关性耳聋基因的探针:CAT、GSTT1、PON2、SOD1、GSTM1、GSTP1、SOD2、GJB1、GJB2、GJB4、KCNE1、KCNQ1、KCNQ4、KCNJ10、HSPA1A、HSPA1B、HSPA1L、CDH23、PCDH15、CASP1、CASP3、CASP4、CASP9、CASP14、CASP5、CASP6、CASP8、CASP10、Notch1、KCNMA1、MYH14、OGG1、IL6、WFS1、CLCNKB、IL1B、IL4R、XPO5、APEX1、GSDMEDNMT1、DNMT3A、EYA4、FOXO3、GRHL2、ITGA8、POU4F3、GRM7、HOTAIR、ATP2B2、XYLT1和GABPA。
2.根据权利要求1所述的一种用于检测噪音相关性耳聋基因的探针组,其特征在于,
捕获CASP9基因的探针组包含9个寡核苷酸探针,所述9个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.1-9所示;
捕获GJB4基因的探针组包含35个寡核苷酸探针,所述35个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.10-44所示;
捕获KCNQ4基因的探针组包含4个寡核苷酸探针,所述4个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.45-48所示;
捕获ITGA8基因的探针组包含2个寡核苷酸探针,所述2个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.49-50所示;
捕获PCDH15基因的探针组包含48个寡核苷酸探针,所述48个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.51-98所示;
捕获CDH23基因的探针组包含2个寡核苷酸探针,所述2个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.99-100所示;
捕获KCNQ1基因的探针组包含50个寡核苷酸探针,所述50个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.101-150所示;
捕获CAT基因的探针组包含42个寡核苷酸探针,所述42个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.151-192所示;
捕获CASP4基因的探针组包含14个寡核苷酸探针,所述14个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.193-206所示;
捕获CASP1基因的探针组包含5个寡核苷酸探针,所述5个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.207-211所示;
捕获HOTAIR基因的探针组包含6个寡核苷酸探针,所述6个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.212-217所示;
捕获GJB2基因的探针组包含34个寡核苷酸探针,所述34个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.218-251所示;
捕获APEX1基因的探针组包含2个寡核苷酸探针,所述2个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.252-253所示;
捕获XYLT1基因的探针组包含39个寡核苷酸探针,所述39个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.254-292所示;
捕获DNMT1基因的探针组包含8个寡核苷酸探针,所述8个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.293-300所示;
捕获CASP14基因的探针组包含10个寡核苷酸探针,所述10个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.301-310所示;
捕获MYH14基因的探针组包含8个寡核苷酸探针,所述8个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.311-318所示;
捕获DNMT3A基因的探针组包含7个寡核苷酸探针,所述7个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.319-325所示;
捕获GABPA基因的探针组包含13个寡核苷酸探针,所述13个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.326-338所示;
捕获SOD1基因的探针组包含20个寡核苷酸探针,所述20个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.339-358所示;
捕获GRM7基因的探针组包含28个寡核苷酸探针,所述28个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.359-386所示;
捕获ATP2B2基因的探针组包含16个寡核苷酸探针,所述16个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.387-402所示;
捕获CASP3基因的探针组包含4个寡核苷酸探针,所述4个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.403-406所示;
捕获POU4F3基因的探针组包含4个寡核苷酸探针,所述4个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.407-410所示;
捕获HSPA1A基因的探针组包含79个寡核苷酸探针,所述79个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.411-489所示;
捕获HSPA1B基因的探针组包含2个寡核苷酸探针,所述2个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.490-491所示;
捕获GSTT1基因的探针组包含2个寡核苷酸探针,所述2个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.492-493所示;
捕获FOXO3基因的探针组包含9个寡核苷酸探针,所述9个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.494-502所示;
捕获EYA4基因的探针组包含27个寡核苷酸探针,所述27个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.503-529所示;
捕获SOD2基因的探针组包含20个寡核苷酸探针,所述20个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.530-549所示;
捕获GSDME基因的探针组包含2个寡核苷酸探针,所述2个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.550-551所示;
捕获PON2基因的探针组包含28个寡核苷酸探针,所述28个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.552-579所示;
捕获GRHL2基因的探针组包含40个寡核苷酸探针,所述40个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.580-619所示;
捕获Notch1基因的探针组包含2个寡核苷酸探针,所述2个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.620-621所示;
捕获GJB1基因的探针组包含7个寡核苷酸探针,所述7个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.622-628所示;
捕获KCNE1基因的探针组包含14个寡核苷酸探针,所述14个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.629-642所示;
捕获GSTP1基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.643所示;
捕获HSPA1L基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.644所示;
捕获CASP5基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.645所示;
捕获CASP6基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.646所示;
捕获CASP8基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.647所示;
捕获CASP10基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.648所示;
捕获KCNMA1基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.649所示;
捕获MYH14基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.650所示;
捕获OGG1基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.651所示;
捕获IL6基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQID No.652所示;
捕获WFS1基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.653所示;
捕获CLCNKB基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.654所示;
捕获IL1B基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.655所示;
捕获IL4R基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.656所示;
捕获XPO5基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.657所示;
捕获GSTM1基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.658所示;
捕获KCNJ10基因的探针组包含1个寡核苷酸探针,所述1个寡核苷酸探针的碱基序列如SEQ ID No.659所示。
3.一种含有如权利要求1所述的用于检测噪音相关性耳聋基因的探针组的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:
用于检测噪音相关性耳聋基因的探针组;
富集缓冲液,所述富集缓冲液中含有引物、人cot-1DNA、鲑鱼精DNA;
杂交缓冲液,所述杂交缓冲液中含有SSPE缓冲液、Denhardt溶液、EDTA和SDS;
结合缓冲液,所述结合缓冲液中含有NaCl,Tris-HCl,EDTA;
漂洗液1,所述漂洗液1中含有SSC和SDS;
漂洗液2,所述漂洗液2中含有SSC和SDS;
NaOH溶液;
Tris-HCl缓冲液,pH 7.5;
PCR反应液,所述PCR反应液中含有dNTPs,引物,Phusion缓冲液,Hotstart Phusion酶,DMSO,dH2O;
TE缓冲液。
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