[发明专利]FFPE样本DNA快速提取的方法在审
| 申请号: | 202111287428.5 | 申请日: | 2021-11-02 |
| 公开(公告)号: | CN113957066A | 公开(公告)日: | 2022-01-21 |
| 发明(设计)人: | 吴开乐;许小锋;沈杲 | 申请(专利权)人: | 合肥诺为尔基因科技服务有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
| 代理公司: | 杭州君度专利代理事务所(特殊普通合伙) 33240 | 代理人: | 乐俊 |
| 地址: | 230000 安徽省合*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | ffpe 样本 dna 快速 提取 方法 | ||
1.FFPE样本DNA快速提取的方法,其特征在于:包括以下几个步骤,
(1)将石蜡组织样本放入切片机切取5-10张切片,厚度为10μm,放入1.5mL离心管中,做好标记;
(2)在装有FFPE组织样本的1.5mL的离心管中加入裂解液buffer200ul、蛋白酶K 20ul和脱蜡液二甲基硅油50ul,涡旋震荡2min,4000r/min离心2min;
(3)水浴锅预热至56℃,将离心过的有FFPE组织样本在56℃条件下孵育1小时,然后水浴锅升温至90℃,继续孵育1小时,可观察到管中分层,上层为油相层,下层为水相层,孵育结束后,取出离心管冷却至室温,用移液器小心将下方水相溶液完全取出转移至另外一支1.5mL离心管中;
(4)在放有水相层的离心管中加入异丙醇200μL和磁珠20μL,混合均匀,室温反应5min;
(5)放磁力架上吸附去上清;
(6)加入400ul清洗液A,上下颠倒混匀30秒使磁珠充分悬浮,简短离心以去除管盖内壁的液滴,待磁珠完全吸附时,用移液器小心去除液体;
然后加入400ul清洗液B,上下颠倒混匀30秒使磁珠充分悬浮,简短离心以去除管盖内壁的液滴,待磁珠完全吸附时,用移液器小心去除液体;
(7)晾干磁珠约2min;
(8)加入50μL洗脱液进入离心管中,室温孵育2min;
(9)放磁力架上吸附取上清,上清即为最终核酸产物。
2.根据权利要求1所述FFPE样本DNA快速提取的方法,其特征在于:在步骤(3)和步骤(4)之间如果需要去除体系中的RNA,可在取出的水相溶液中加入2μl RNase A,室温放置5min即可。
3.根据权利要求1所述FFPE样本DNA快速提取的方法,其特征在于:所述裂解液Buffer含有:10mM EDTA、30mM Tris-HCl、3M异硫氰酸胍、Tween20。
4.根据权利要求1所述FFPE样本DNA快速提取的方法,其特征在于:所述蛋白酶K浓度为20mg/mL。
5.根据权利要求1所述FFPE样本DNA快速提取的方法,其特征在于:所述磁珠为二氧化硅磁珠。
6.根据权利要求1所述FFPE样本DNA快速提取的方法,其特征在于:所述清洗液A含有:1.0M NaCl,50mM MOPS和15%异丙醇。
7.根据权利要求1所述FFPE样本DNA快速提取的方法,其特征在于:所述清洗液B含有:50mM Tris-HCl,80%乙醇。
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