[发明专利]肠道菌群丰度检测在肝纤维化、肝硬化中的应用在审

专利信息
申请号: 202111148836.2 申请日: 2021-09-29
公开(公告)号: CN113846140A 公开(公告)日: 2021-12-28
发明(设计)人: 沈悦;吴盛迪;蒋炜 申请(专利权)人: 复旦大学附属中山医院
主分类号: C12Q1/06 分类号: C12Q1/06;C12Q1/14;C12R1/46;C12R1/01
代理公司: 上海申汇专利代理有限公司 31001 代理人: 翁若莹;张业民
地址: 200032 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 肠道 菌群丰度 检测 纤维化 肝硬化 中的 应用
【说明书】:

发明涉及一种肠道菌群丰度检测在肝纤维化、肝硬化中的应用,属于生物医药技术领域。本发明通过收集慢性乙型肝炎病人的粪便标本,进行宏基因组菌群测序,获得相应属水平Streptococcus、Lactococcus、Veillonella、Faecalibacterium的丰度值;根据模型公式计算丰度值得分,根据得分评估患者是否有肝纤维化、肝硬化的风险。以菌群丰度特征为基础,通过对乙肝病人进行特异的肠道微生物群组合丰度的检测,获得对肝脏纤维化严重程度的评估结果和早期肝脏相关事件的预测,为对患者制定进一步优化的监测和干预策略提供参考;也避免了多次肝活检给患者带来的痛苦。

技术领域

本发明涉及一种肠道菌群丰度检测在肝纤维化、肝硬化中的应用,属于生物医药技术领域。

背景技术

慢性乙型肝炎目前仍然是我国慢性肝病和肝脏相关结局事件(包括:肝硬化失代偿、肝细胞癌和死亡)发生的主要原因。大约20%到30%的慢性乙型肝炎患者会发生肝脏相关结局事件,这一比例在乙肝代偿性肝硬化患者中会进一步升高。因此,对乙肝病人进行肝脏纤维化严重程度评估和早期肝脏相关事件的检测,对其进一步制定优化的监测和干预策略就非常重要。

目前在临床实践中,肝活检组织的病理结果被认为是评估乙肝病人肝脏纤维化严重程度的金标准。但肝活检是一种有创的检测方式,术中病人会面临出血的风险。肝活检过程还具有取样误差和结果判读主观性等缺点。同时,在临床实践中为了预测肝脏相关结局事件的风险或抗病毒治疗的效果,前后顺序或多次活检很难实现。

在早期胚胎学中,肝脏由前肠起源发育,在解剖和功能上都与肠道相辅相成,构成“肠-肝轴”。在乙型肝炎病毒的慢性感染中,肠道微生物能够激活全身免疫。此外,乙型肝炎病毒感染患者的肠道通透性发生改变,门静脉中细菌易位和内毒素负荷增加,促进免疫介导的肝损伤继而引发慢性炎症导致肝脏病变,因此,肠道菌群稳态失调在乙型肝炎病毒慢性感染中的作用也成为了国内外的研究热点。但是目前还没有研究将肠道菌群和乙肝无创诊断相结合,因此利用肠道菌群丰度特征为基础进行乙肝肝纤维化、肝硬化无创诊断具有一定独创性。

发明内容

本发明的目的是为解决如何利用肠道菌群丰度特征为基础进行乙肝肝纤维化、肝硬化无创检测的技术问题。

为达到解决上述问题的目的,本发明所采取的技术方案是提供一种肠道菌群丰度检测在肝纤维化、肝硬化中的应用,所述肠道菌群丰度检测是通过收集慢性乙型肝炎病人的粪便标本,进行宏基因组菌群测序,获得相应属水平Streptococcus、Lactococcus、Veillonella、Faecalibacterium的丰度值;根据模型公式计算得分:

5.090*Streptococcus+3.331*10^5Lactococcus+1.692*Veillonella+7.139*Faecalibacterium-0.944;

若得分大于0.658,则提示患者有肝纤维化、肝硬化的风险。

本发明提供一种肠道菌群丰度检测在制备乙肝肝纤维化和/或肝硬化诊断试剂盒中的应用。

本发明提供一种肠道菌群丰度检测在制备乙肝肝纤维化和/或肝硬化预后试剂盒中的应用。

相比现有技术,本发明具有如下有益效果:

本发明通过提取乙肝病人粪便中微生物菌群的DNA并测序从而获得微生物多样性、种类和丰度的特征,并以微生物的丰度特征为基础进行肝纤维化、肝硬化的预测。以菌群丰度特征为基础,结合慢性乙型肝炎病人肠道菌群测序和无创检测,建立慢性乙型病毒性肝炎肝纤维化、肝硬化无创检测的肠道微生物群组合;通过对乙肝病人进行特异的肠道微生物群组合丰度的检测,获得对肝脏纤维化严重程度的评估结果和早期肝脏相关事件的预测,作为对患者制定进一步优化的监测和干预策略的参考;也避免了多次肝活检给患者带来的痛苦。

附图说明

图1为个属水平肠道菌群的检测ROC曲线。

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