[发明专利]一种SNP分子标记、PCR引物及应用

权利要求书

1.一种SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记包括位于rpoB基因上的SNP1～SNP8和位于gyrB基因上的SNP 9～SNP 15；其中

SNP1位于SEQ ID No.1所示序列5’端起14位，碱基是A、G；

SNP2位于SEQ ID No.1所示序列5’端起26位，碱基是C、G；

SNP3位于SEQ ID No.1所示序列5’端起65位，碱基是C、T；

SNP4位于SEQ ID No.1所示序列5’端起128位，碱基是C、G；

SNP5位于SEQ ID No.1所示序列5’端起170位，碱基是G、T或C；

SNP6位于SEQ ID No.1所示序列5’端起311位，碱基是C、G或T；

SNP7位于SEQ ID No.1所示序列5’端起421位，碱基是C、T；

SNP8位于SEQ ID No.1所示序列5’端起498位，碱基是G、A；

SNP9位于SEQ ID No.2所示序列5’端起32位，碱基是A、G或C；

SNP10位于SEQ ID No.2所示序列5’端起38位，碱基是A、C或G；

SNP11位于SEQ ID No.2所示序列5’端起59位，碱基是G、T、C或A；

SNP12位于SEQ ID No.2所示序列5’端起149位，碱基是A、G或C；

SNP13位于SEQ ID No.2所示序列5’端起236位，碱基是C、T或G；

SNP14位于SEQ ID No.2所示序列5’端起302位，碱基是C、T；

SNP15位于SEQ ID No.2所示序列5’端起437位，碱基是G或A。

2.用于扩增权利要求1所述的SNP分子标记的PCR引物，其特征在于，包括用于扩增SEQID No.1所示序列的引物SEQ ID No.3和SEQ ID No.4；以及用于扩增SEQ ID No.2所示序列的引物SEQ ID No.5和SEQ ID No.6。

3.用于检测权利要求1所述的SNP分子标记的试剂盒，其特征在于，包含权利要求2所述的PCR引物；优选的，所述试剂盒还包含dNTPs、Taq DNA聚合酶、Mg²⁺、PCR反应缓冲液中的至少一种。

4.一种基因芯片，其特征在于，所述基因芯片包括如权利要求2所述的PCR引物。

5.权利要求1所述的SNP分子标记或权利要求2所述的PCR引物或权利要求3所述的试剂盒用于检测和/或鉴定结核分枝杆菌复合群中的应用，所述应用为非疾病诊断目的。

6.一种非疾病诊断目的的鉴定结核分枝杆菌复合群的方法，其特征在于，通过检测如权利要求1所述的SNP分子标记的多态性来判断待测样品的菌种类型。

7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，SNP分子标记的多态性的检测方法包括以下一种或几种：基于凝胶电泳的SNP检测法、DNA测序法、DNA芯片法、变性高效液相色谱法或质谱检测法。