[发明专利]基于自监督学习的药物小分子性质预测方法、装置及设备有效

专利信息
申请号: 202111005170.5 申请日: 2021-08-30
公开(公告)号: CN113707235B 公开(公告)日: 2023-09-26
发明(设计)人: 王俊 申请(专利权)人: 平安科技(深圳)有限公司
主分类号: G16C20/30 分类号: G16C20/30;G16C20/20;G16C20/70;G06N3/0464;G06N3/0895
代理公司: 北京中强智尚知识产权代理有限公司 11448 代理人: 刘敏
地址: 518000 广东省深圳市福田街*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 基于 监督 学习 药物 分子 性质 预测 方法 装置 设备
【说明书】:

本申请公开一种基于自监督学习的药物小分子性质预测方法、装置及设备,涉及人工智能技术领域,包括:生成目标药物小分子的分子图结构,并利用目标图神经网络模型确定分子图结构的第一特征向量;提取目标药物小分子的第一分子线性输入规范数据,以及不同药物小分子的第二分子线性输入规范数据,利用预设语言模型确定第一分子线性输入规范数据的第二特征向量和第二分子线性输入规范数据的第三特征向量;利用第一特征向量、第二特征向量和第三特征向量调整目标图神经网络模型的模型参数,以基于调整后的目标图神经网络模型输出目标药物小分子满足预设特征约束条件的目标特征向量;将目标特征向量输入训练完成的性质预测模型中,确定性质预测结果。

技术领域

本申请涉及人工智能技术领域,尤其涉及到一种基于自监督学习的药物小分子性质预测方法、装置及设备。

背景技术

新药研发周期十分漫长,包括靶标选择与验证、从苗头化合物(Hit)的发现到先导化合物(Lead)最后到候选药物(Candidate)的发现与优化,层层筛选,成本高昂。为了充分挖掘药物分子背后的规律,加速发现药物研发的速度,从本世纪开始,药物开发领域的研究人员尝试将机器学习方法引入到药物化学研究中,以期解决药物开发过程中面临的问题。

传统的药物小分子性质预测方法要求研究人员进行特征工程以合理选择药物的分子描述符作为模型的特征输入,进行定量构效关系或构效关系(QSAR/QSPR)建模。而分子描述符的选取是一个繁琐、耗时的过程,而且选取的描述符会对模型施加较强的预设先验,使模型产生偏差,进而影响模型的预测性能。

发明内容

有鉴于此,本申请提供了一种基于自监督学习的药物小分子性质预测方法、装置及设备,可用于解决目前对药物小分子性质预测的效率较低、预测性能较差的技术问题。

根据本申请的一个方面,提供了一种基于自监督学习的药物小分子性质预测方法,该方法包括:

依据目标药物小分子的化学分子结构生成分子图结构,并利用目标图神经网络模型确定所述分子图结构对应的第一特征向量;

提取所述目标药物小分子对应的第一分子线性输入规范数据,以及与所述目标药物小分子不同化学分子结构的药物小分子对应的第二分子线性输入规范数据,并利用预设语言模型确定所述第一分子线性输入规范数据对应的第二特征向量以及所述第二分子线性输入规范数据对应的第三特征向量;

利用所述第一特征向量、所述第二特征向量和所述第三特征向量调整所述目标图神经网络模型的模型参数,以基于调整后的目标图神经网络模型输出所述目标药物小分子对应满足预设特征约束条件的目标特征向量;

将所述目标特征向量输入训练完成的性质预测模型中,确定所述目标药物小分子的性质预测结果。

根据本申请的另一个方面,提供了一种基于自监督学习的药物小分子性质预测装置,该装置包括:

第一确定模块,用于依据目标药物小分子的化学分子结构生成分子图结构,并利用目标图神经网络模型确定所述分子图结构对应的第一特征向量;

第二确定模块,用于提取所述目标药物小分子对应的第一分子线性输入规范数据,以及与所述目标药物小分子不同化学分子结构的药物小分子对应的第二分子线性输入规范数据,并利用预设语言模型确定所述第一分子线性输入规范数据对应的第二特征向量以及所述第二分子线性输入规范数据对应的第三特征向量;

调整模块,用于利用所述第一特征向量、所述第二特征向量和所述第三特征向量调整所述目标图神经网络模型的模型参数,以基于调整后的目标图神经网络模型输出所述目标药物小分子对应满足预设特征约束条件的目标特征向量;

第三确定模块,用于将所述目标特征向量输入训练完成的性质预测模型中,确定所述目标药物小分子的性质预测结果。

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