[发明专利]一种病原微生物参考知识库的最大多样性聚类构建方法

权利要求书

1.一种病原微生物参考知识库的最大多样性聚类构建方法，其特征在于，该构建方法具体步骤如下：

(1)收集病原微生物全基因组序列：对云端数据库中存储的病原微生物全基因组序列进行提取，并对提取出的基因组序列进行去重筛选；

(2)将序列进行OTU聚类，并进行统计：将筛选完成的基因组序列进行OTU聚类，同时将无法聚类的基因组序列处理生成错误序列，并将其录入OTU筛选表中；

(3)对错误序列进行检测删除并进行记录：对错误序列进行数据筛错，并将错误序列信息进行更新，同时对其重新进行OTU聚类处理；

(4)对各病原微生物进行注释匹配：依据OTU聚类表中分类完成的数据进行数据检索，并对各病原微生物全基因组序列的相关信息进行抓取，同时对其进行信息匹配；

(5)构建微生物知识库，将数据表反馈给工作人员：将信息匹配完成的病原微生物数据整合生成微生物知识库，并将未匹配成功的病原微生物全基因组序列反馈给工作人员，同时由工作人员对其进行信息补充，微生物知识库进行数据更新。

2.根据权利要求1所述的一种病原微生物参考知识库的最大多样性聚类构建方法，其特征在于，步骤(1)中所述去重筛选具体步骤如下：

步骤一：服务器将病原微生物全基因组序列依据首字母A～Z进行有序排列，并将其分为26组数据，同时将未排序的病原微生物全基因组序列组成第27组数据；

步骤二：依次对各组数据中的病原微生物全基因组序列进行重复数据查询，并将其中重复的病原微生物全基因组序列删除。

3.根据权利要求1所述的一种病原微生物参考知识库的最大多样性聚类构建方法，其特征在于，步骤(2)中所述OTU聚类具体步骤如下：

第一步：工作人员设置百分比标识阈值X，27组数据与参考数据库中预先定义的聚类中心对齐；

第二步：各组数据依次对参考数据库进行查询，如果读取匹配的参考序列相似度大于或等于X，则将其分配给该参考序列定义的OTU，并将其处理生成OTU1；

第三步：将无法匹配参考数据库的病原微生物全基因组序列进行de novo，并将匹配完成的序列处理生成OTU2；

第四步：将未成功匹配的病原微生物全基因组序列标记为错误序列，同时将OTU1以及OTU2中的所有序列录入OTU聚类表中，将错误序列录入OTU筛选表中。

4.根据权利要求3所述的一种病原微生物参考知识库的最大多样性聚类构建方法，其特征在于，步骤(3)中所述数据筛错具体步骤如下：

S1：对OTU筛选表中的错误序列依次进行序列检测，并判断其是否为嵌合体序列或测序错误序列；

S2：若为嵌合体序列或测序错误序列，则将该序列删除，并在OTU筛选表中更新其相关信息；

S3：若不为嵌合体序列或测序错误序列，则对该序列重新进行OUT聚类处理，若聚类处理成功，则将其移出OTU筛选表，并更新OTU聚类表，若OUT聚类失败，同时将其信息反馈给工作人员，并由工作人员对其进行手动操作，同时依据工作人员操作信息更新OTU筛选表以及OTU聚类表。

5.根据权利要求1所述的一种病原微生物参考知识库的最大多样性聚类构建方法，其特征在于，步骤(4)中所述信息匹配具体步骤如下：

SS1：将OTU聚类表中各病原微生物全基因组序列依次与注释数据库进行比对；

SS2：依据比对结果将各病原微生物全基因组序列依据域、界、门、纲、目、科、属以及种进行分类统计；

SS3：与互联网通信连接，并开始对各病原微生物全基因组序列进行信息检索抓取，同时将抓取到的信息与对应病原微生物全基因组序列进行数据匹配。

6.根据权利要求1所述的一种病原微生物参考知识库的最大多样性聚类构建方法，其特征在于，步骤(5)中所述数据更新具体步骤如下：

P1：接收用户补充的数据信息，并将其与对应病原微生物全基因组序列进行匹配；

P2：将微生物知识库中的专业名词进行数据提取，并对各专业名词进行解释说明，同时将其匹配至对应病原微生物；

P3：更新完成，将更新信息反馈至各工作人员以及用户的智能设备。