[发明专利]基于U-Transformer的直肠癌CT影像自动分割方法有效
申请号: | 202110981706.0 | 申请日: | 2021-08-25 |
公开(公告)号: | CN113674253B | 公开(公告)日: | 2023-06-30 |
发明(设计)人: | 宋海裕;王浩宇;吴海燕;张志强;邓胜春;冯小青;陈琰宏;彭娟娟 | 申请(专利权)人: | 浙江财经大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06N3/0455;G06N3/08 |
代理公司: | 杭州君度专利代理事务所(特殊普通合伙) 33240 | 代理人: | 朱月芬 |
地址: | 310018 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 transformer 直肠癌 ct 影像 自动 分割 方法 | ||
1.基于U-Transformer的直肠癌CT影像自动分割方法,其特征在于包括如下步骤
步骤1,实验数据的预处理;
步骤2,构建U-Transformer网络模型;
步骤3,训练U-Transformer网络模型;
步骤4,采用训练好的U-Transformer网络模型进行CT影像中直肠癌的分割,并对分割效果进行评估;
步骤2的具体实现过程包括:
步骤2.1:构建Patch Embedding层;将二维的CT影像变换得到M个大小为P2·C的一维patch embeddings;C为通道数,每个patch的大小为P2;
步骤2.2:构建Swin Transforner Block;先使用窗口多头注意力机制W-MSA,计算窗口内部的自注意力得分,通过window reverse操作将得到的特征图还原为与输入特征一样的大小;再使用滑动窗口注意力机制SW-MSA计算不同窗口之间的注意力得分,通过windowreverse操作将得到的特征图还原为与输入特征一样的大小;
步骤2.3:将Patch Merging层与Swin Transformer Block共同构成编码器;在第一层编码器中,使用两个Swin Transformer Block进行特征提取;在第二层编码器中,使用六个Swin Transformer Block进行特征提取;在第三层编码器中,使用两个Swin TransformerBlock进行特征提取;
步骤2.4:在每个解码器中构建全尺度跳跃连接,融合低层细节和高层语义,充分利用多尺度特征;
步骤2.5:对三层编码后的特征图进行三层解码操作;
步骤2.6:使用双线性插值将经过三层解码操作后的特征图进行扩展;
步骤2.7:构建线性投影操作,实现像素级分割。
2.根据权利要求1所述的基于U-Transformer的直肠癌CT影像自动分割方法,其特征在于所述步骤4的具体过程包括:
步骤4.1:引入Dice相似系数、PPV系数和灵敏度系数来评价分割的效果。
3.根据权利要求1所述的基于U-Transformer的直肠癌CT影像自动分割方法,其特征在于所述步骤2.1中的Patch Embedding层具体实施方式为:
2.1.1对输入的2D医学影像记为其中H和W为图像的长和宽,C为通道数;
2.1.2将图像分割为多个大小相同的patchs,patchs的表达式为其中是最终分割的patchs数量,每个patch的大小为P2;
2.1.3通过线性变换得到M个向量长度为P2·C的一维patchembeddings;
2.1.4对每一个patch embeddings设置一个一维的位置编码,最终patch embeddings表示如下:
其中,代表了位置编码信息。
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