[发明专利]一种鉴别斯氏鼢鼠的试剂盒及方法在审
申请号: | 202110945423.0 | 申请日: | 2021-08-17 |
公开(公告)号: | CN113637771A | 公开(公告)日: | 2021-11-12 |
发明(设计)人: | 张同作;蔡振媛;高红梅;秦冲;韩晓玲;汪海静;宋鹏飞;刘道鑫;李斌;徐波 | 申请(专利权)人: | 中国科学院西北高原生物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 张娟;肖柯岑 |
地址: | 810000 *** | 国省代码: | 青海;63 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 斯氏鼢鼠 试剂盒 方法 | ||
本发明提供了一种鉴别斯氏鼢鼠的试剂盒,它包括检测待检物种的如下3个SNP位点中任意一个或多个的试剂:12S rRNA基因中的SEQ ID NO:5所示保守motif序列的第33位,SEQ ID NO:6所示保守motif序列的第7位;16S rRNA基因中的SEQ ID NO:7所示保守motif序列的第33位。本发明提供了一种简便、准确鉴定斯氏鼢鼠物种的试剂盒以及鉴定斯氏鼢鼠的方法,解决了通过形态进行鼢鼠物种鉴定的难题,在鼢鼠的物种鉴别中具有优异的应用前景。
技术领域
本发明属于鉴定技术领域,具体涉及一种鉴别斯氏鼢鼠的试剂盒及方法。
背景技术
鼢鼠是鼢鼠亚科(Myospalacinae)动物的统称,是一种适应地下生活的啮齿类动物。鼢鼠体型粗壮、圆柱形,头宽扁,头部具有触须,鼻端平钝,有裸露鼻垫,尾及四肢短,眼睛极小,视力差,几乎被毛所隐盖,耳廓退化,隐于毛下。鼢鼠主要分布于我国,也见于蒙古和西伯利亚,栖息于森林边缘、草原和农田,白天居住在地洞中,晚上偶尔会到地面活动,以植物的根、茎、种子为食,在洞穴中储存大量食物。鼢鼠挖洞速度极快,洞穴系统复杂,分支多,平时地面没有明显出口,但附近有不规则的土堆。
现存鼢鼠包括凸颅鼢鼠属(Eospalax)和平颅鼢鼠属(Myspalax),平颅鼢鼠属内物种较少,目前普遍认为平颅鼢鼠属下有3个物种,即草原鼢鼠(M.aspalax)、阿尔泰鼢鼠(M.myospalax)和东北鼢鼠(M.psilurus);凸颅鼢鼠属下有6个物种:中华鼢鼠(E.fontanieri)、甘肃鼢鼠(E.cansus)、秦岭鼢鼠(E.rufescens)、罗氏鼢鼠(E.rothschildi)、斯氏鼢鼠(E.smithi)和高原鼢鼠(E.baileyi)。其中,斯氏鼢鼠分布于甘肃(临潭及其附近)、宁夏等地,一般栖息于黄土高原、草原、耕地,几乎终生都生活在密闭的地下洞道系统中,独特的地下生活方式使得其在觅食、婚配、繁殖等多方面具有特殊性,引起了科学家的广泛兴趣。
识别鉴定生物种类是认识和保护生物多样性的基础,每种生物只有能够被准确识别后,才能开展更多领域的研究。但是由于不同鼢鼠生活环境相似而形态趋同,未经专业训练通过形态进行物种准确鉴定非常困难。
因此,研究一种能够快速、准确进行斯氏鼢鼠物种鉴定的方法与试剂,具有非常重要的意义。
发明内容
本发明的目的在于提供一种能够简便、准确鉴定斯氏鼢鼠物种的试剂盒和方法,解决通过形态进行鼢鼠物种鉴定的难题。
本发明提供了一种鉴别斯氏鼢鼠的试剂盒,它包括检测待检物种的如下3个SNP位点中任意一个或多个的试剂:
12S rRNA基因中的SEQ ID NO:5所示保守motif序列的第33位,SEQ ID NO:6所示保守motif序列的第7位;
16S rRNA基因中的SEQ ID NO:7所示保守motif序列的第33位。
进一步地,上述试剂是同时检测所述3个SNP位点的试剂;
更进一步地,上述SNP位点的碱基如下:
12S rRNA基因中的SEQ ID NO:5所示保守motif序列的第33位为T,SEQ ID NO:6所示保守motif序列的第7位为T;
16S rRNA基因中的SEQ ID NO:7所示保守motif序列的第33位为T。
经过发明人研究发现,本申请前述3个SNP位点通常是同时存在,即当SEQ ID NO:5所示保守motif序列的第33位碱基为T时,SEQ ID NO:6所示保守motif序列的第7位碱基为T、SEQ ID NO:7所示保守motif序列的第33位碱基为T。进一步的实验还发现,只有斯氏鼢鼠的基因组具有前述3个SNP位点,因而通过检测前述3个SNP中的任意一个或者任意多个位点,即可鉴别待检物种是否为斯氏鼢鼠。
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