[发明专利]用于评估二型糖尿病患者粪菌移植疗效的微生物标志物及其应用

说明书

本发明公开一种肠道宏观基因组特征作为二型糖尿病患者的粪菌移植疗效筛选标志，所述肠道微生物宏基因特征为Rinkenellaceae科和Anaerotruncus属肠道菌群，根据这些特定肠道菌群标志物的表达水平，来选择适合粪菌移植治疗的二型糖尿病患者。根据此肠道菌群生物标志物和不同的检测技术平台，设计开发相应的检测试剂盒。此系统和产品可用于基于个体化的二型糖尿病精准治疗。

技术领域

本发明属于微生物检测技术领域，具体涉及一组人二型糖尿病粪菌移植疗效相关的肠道菌群标志物及其在临床精准医学中的应用。

背景技术

糖尿病是当前威胁全球的重要慢性疾病之一，药物在糖尿病治疗的过程中占有重要地位。近来根据二型糖尿病发病的生理病理机制研制很多的靶点药物，如GLP-1受体激动剂、DDP-4抑制剂及SGLT-1、2抑制剂等。但是在治疗的过程中，二型糖尿病对药物对疗效反应个体化差异普遍存在。其发生机制与遗传、性别、年龄、身高、体重、生活饮食习惯、疾病状态及合并用药等众多因素有关。虽然药物基因组学确定了个人遗传信息的使用，在临床个体化用药和评估药物不良反应发生风险方面起着越来越重要的作用。然而有关糖尿病药物的“基因化精准治疗”并不是很多，虽然报道有机阳离子转运蛋白1（OCT1）基因的多态性影响二甲双胍的摄取，从而影响药物的疗效和代谢。噻唑烷二酮类药物基因组学研究主要集中在CYP450酶，脂联素基因多态性的上。近来研究发现，宿主肠道微生物的构成变化影响糖尿病药物的代谢和疗效，患者对治疗的异质反应可能是由于肠道微生物组的差异引起。因此，事先了解个体的微生物组成可能有助于预测治疗结果和/或建议最佳治疗策略。Gu等证明肠道微生物组可以对新发的二型糖尿病（T2D）患者进行分类，分为两个聚类，即聚类P（由Prevotella主导）和B（以Bacteroides为主），发现阿卡波糖治疗三个月后糖尿病患者，与B类组相比，P类组代谢改善更加明显。这些发现表明，量化患者粪便样本中的微生物组成有助于预测治疗结果并将患者分为潜在的反应者或无反应者，特别是糖尿病药物和肠道菌群相互作用对二型糖尿病的疗效影响，目前仍然不是很清楚。所以探索降糖药物和肠道微生物的相互作用，更好的精准治疗二型糖尿病具有重要的临床意义。