[发明专利]一种脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法和装置在审

专利信息
申请号: 202110875233.6 申请日: 2021-07-30
公开(公告)号: CN113851194A 公开(公告)日: 2021-12-28
发明(设计)人: 武嘉琦;吉训明;李明;高渊;卫慧敏;马红蕊;马瑾 申请(专利权)人: 北京航空航天大学;首都医科大学宣武医院
主分类号: G16B50/00 分类号: G16B50/00;G06F16/31;G06F16/335;G06F16/36
代理公司: 北京开阳星知识产权代理有限公司 11710 代理人: 王艳斌
地址: 100191*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 脑卒中 病因 靶向 生物 标志 数据库 构建 方法 装置
【说明书】:

本公开涉及一种脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法和装置,其中,方法包括:接收脑卒中致病病因学生物标志物和药物关系的原始数据文献;对原始数据文献进行筛选,获取目标数据文献;根据目标数据文献建立数据文件,数据文件包括脑卒中病因学生物标志物数据表、药物数据表以及生物标志物‑药物关系数据表并存储;其中,每个数据表各自含有多个字段,脑卒中病因学生物标志物数据表和药物数据表分别与脑卒中病因学生物标志物‑药物关系数据表有相同字段,每个数据表包含依据各自包含的每个字段建立的索引。由此,构建的数据库信息准确可靠、规范标准,利于信息传递以及数据库的管理,能够用于解读通过各种方式获取脑卒中生物标志物信息。

技术领域

本公开涉及医疗数据库技术领域,尤其涉及一种脑卒中病因学靶向生物标志物数据库构建方法和装置。

背景技术

目前,在测序技术的发展及循证医学的推动下,基因组学、表达谱等生物信息领域与医学领域交叉越来越密切。脑卒中的诊断和治疗方案不再是完全依赖传统的表观判断,更多的是通过检测基因变化提供更可靠的证据。

相关技术中,大批的科研人员及机构投入到药物与基因组学的研究中,大量的实验证据产出为基因组变化与药物关系提供了有力的支持。而精准医疗个体化治疗正是在这些大量的研究数据上建立起来的,为了使药物在临床治疗中更好的发挥作用,减少不良反应的发生,给患者提供最佳的药物使用方案,根据患者的个体基因型的差异“量体裁衣”,选择特异和最佳的药物方案进行治疗。个体化治疗帮助患者选择合适的药物,提高治疗的针对性,最大程度的延长患者的生存期。这类基因检测在临床上的应用,是实现现行医疗模式转变的有效手段。同时必将大大促进临床合理用药的发展进程,为医药学事业的发展做出贡献。

因此,数据库是信息管理最有效的手段,因此脑卒中病因学靶向生物标志物数据库分析平台是个体化治疗知识信息管理的重要信息传递的方法。

然而,有一些相关的数据库,提供的信息并不是很全面。另外这些数据库对基因,药物的名称,生物标志物信息,生物标志物-药物的关系,参考资料都没有统一规范的标准,这对参考数据源可靠性,及信息传递及管理带来很大问题。导致数据库并不太适用于测序检测得到的生物标志物信息对应药物关系的直接解读。

发明内容

为了解决上述技术问题或者部分地解决上述技术问题,本专利公开提供了一种脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法,解决了脑卒中生物标志物信息关联度不高,新生物标志物挖掘困难,且无专门的储存,上传,挖掘的平台的问题。

本公开第一方面实施例提出了一种脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法,包括:

接收脑卒中致病病因学生物标志物和药物关系的原始数据文献;

对所述原始数据文献进行筛选,获取目标数据文献;

根据所述目标数据文献建立数据文件,所述数据文件包括脑卒中生物标志物数据表、药物数据表以及生物标志物-药物关系数据表并存储;其中,每个数据表各自含有多个字段,所述脑卒中生物标志物数据表和所述药物数据表分别与所述脑卒中生物标志物-药物关系数据表有相同字段,所述每个数据表包含依据各自包含的每个字段建立的索引。

在本公开的一个实施例中,所述对所述原始数据文献进行筛选,获取目标数据文献包括:

确定第一参数,根据所述第一参数对所述原始数据文献进行第一筛选,获取第一目标数据文献;其中,所述第一参数是通过统计所述原始数据文献中包含的第一关键词组合中各关键词出现的次数N来设置的,所述第一关键词组合包含以下四个预置词汇集中的每个预置词汇集中的至少一个词汇:预置的脑卒中致病病因名称词汇集、预置的脑卒中生物标志物词汇集、预置的药物和治疗方法词汇集、以及预置的药效或治疗效果词汇集;

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