[发明专利]一种脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法和装置在审
| 申请号: | 202110875233.6 | 申请日: | 2021-07-30 |
| 公开(公告)号: | CN113851194A | 公开(公告)日: | 2021-12-28 |
| 发明(设计)人: | 武嘉琦;吉训明;李明;高渊;卫慧敏;马红蕊;马瑾 | 申请(专利权)人: | 北京航空航天大学;首都医科大学宣武医院 |
| 主分类号: | G16B50/00 | 分类号: | G16B50/00;G06F16/31;G06F16/335;G06F16/36 |
| 代理公司: | 北京开阳星知识产权代理有限公司 11710 | 代理人: | 王艳斌 |
| 地址: | 100191*** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 脑卒中 病因 靶向 生物 标志 数据库 构建 方法 装置 | ||
1.一种脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法,其特征在于,包括:
接收脑卒中致病病因学生物标志物和药物关系的原始数据文献;
对所述原始数据文献进行筛选,获取目标数据文献;
根据所述目标数据文献建立数据文件,所述数据文件包括脑卒中病因学生物标志物数据表、药物数据表以及生物标志物-药物关系数据表并存储;其中,每个数据表各自含有多个字段,所述脑卒中生物标志物数据表和所述药物数据表分别与所述脑卒中生物标志物-药物关系数据表有相同字段,所述每个数据表包含依据各自包含的每个字段建立的索引。
2.根据权利要求1所述的脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法,其特征在于,所述对所述原始数据文献进行筛选,获取目标数据文献,包括:
确定第一参数,根据所述第一参数对所述原始数据文献进行第一筛选,获取第一目标数据文献;其中,所述第一参数是通过统计所述原始数据文献中包含的第一关键词组合中各关键词出现的次数N来设置的,所述第一关键词组合包含以下四个预置词汇集中的每个预置词汇集中的至少一个词汇:预置的脑卒中致病病因名称词汇集、预置的脑卒中生物标志物词汇集、预置的药物和治疗方法词汇集、以及预置的药效或治疗效果词汇集;
确定第二参数,根据所述第二参数对剩余的所述原始数据文献进行第二筛,获取第二目标数据文献,所述第二参数是通过统计所述原始数据文献中包含的第二关键词组合中各关键词出现的次数Μ来设置的,所述第二关键词组合包含以下五个预置词汇集中的每个预置词汇集中的至少一个词汇:预置的脑卒中致病病因词汇集、预置的脑卒中生物标志物
词汇集、预置的药物和治疗方法词汇集、预置的药效或治疗效果词汇集以及预置的期刊词汇集,所述第二关键词组合包含所述第一关键词组合中的每个关键词;其中,M和N为两个自然数集合,对于同一关键词i,MiNi。
3.根据权利要求2所述的脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法,其特征在于,还包括:
以NCBI基因数据库中包含的基因表示为标准转换所述原始数据文献中的基因名称,以人类参考基因组HG19版本为标准转换所述原始数据文献中的脑卒中生物标志物基因变异的类型及位置。
4.根据权利要求1所述的脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法,其特征在于,
所述脑卒中生物标志物数据表与所述脑卒中生物标志物-药物关系数据表的相同字段是所述脑卒中生物标志物数据表的主键;
所述药物数据表与所述脑卒中生物标志物-药物关系数据表的相同字段是所述药物数据表的主键;其中,数据表的主键为唯一标识其所在数据表中的一个记录的一个或多个字段的组合。
5.根据权利要求1所述的脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法,其特征在于,所述数据文件还包括:
脑卒中生物标志物信息数据表、信息原始来源数据表和样本信息数据表;所述信息原始来源数据表与所述脑卒中生物标志物-药物关系数据表有相同字段,所述样本信息数据表与所述脑卒中生物标志物数据表有相同字段。
6.根据权利要求5所述的脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法,其特征在于,
所述脑卒中生物标志物信息数据表与所述脑卒中生物标志物数据表的相同字段为所述脑卒中生物标志物信息数据表的主键,所述信息原始来源数据表与所述脑卒中生物标志物-药物关系数据表的相同字段为所述信息原始来源数据表的主键,所述样本信息数据表与所述脑卒中生物标志物数据表的相同字段为所述样本信息数据表的主键。
7.根据权利要求1-6任一项所述的脑卒中病因靶向生物标志物数据库构建方法,其特征在于,还包括:
接收脑卒中生物标志物和药物关系的更新数据;
根据所述更新数据更新所述数据文件。
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