[发明专利]一种线性探针及利用其检测miRNA的方法有效
| 申请号: | 202110749184.1 | 申请日: | 2021-07-01 |
| 公开(公告)号: | CN113481197B | 公开(公告)日: | 2023-04-11 |
| 发明(设计)人: | 刘孟坛 | 申请(专利权)人: | 长沙智飞生物科技有限公司 |
| 主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/686 |
| 代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 颜希文 |
| 地址: | 410000 湖南省长沙市*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 线性 探针 利用 检测 mirna 方法 | ||
1.一种线性探针,其特征在于:所述线性探针至少包括a、b和c三个区域;
所述b区域的3’端和a区域的5’端相连,所述c区域的3’端和b区域的5’端相连;
所述a区域的核苷酸序列和靶标核酸互补配对,b区域的核苷酸序列通过减少空间位阻协助成环,c区域的核苷酸序列和靶标核酸5’端相同;
所述b区域是随机核苷酸序列,通过调节GC含量,以使上下游引物退火温度相近;
所述b区域是随机核苷酸序列,核苷酸为10~40bp。
2.根据权利要求1所述的线性探针,其特征在于:所述靶标核酸包括RNA和DNA。
3.根据权利要求1所述的线性探针,其特征在于:所述线性探针还包括d区域;所述d区域的3’端与c区域的5’端相连;所述d区域是延长线性探针的核苷酸序列,所述d区域是随机核苷酸序列,通过调节GC含量,以使上下游引物退火温度相近。
4.根据权利要求3所述的线性探针,其特征在于:所述d区域的5’端还可以包含c区域核苷酸序列。
5.一种利用线性探针检测靶标miRNA的方法,其特征在于:所述方法包括以下步骤:
(1)采用权利要求1~4任一所述的线性探针将靶标miRNA逆转录为cDNA;
(2)以步骤(1)得到的cDNA设计PCR引物,PCR扩增进行检测;
所述步骤(1)具体包括以下步骤:
i、线性探针与靶标a* 区域退火杂交,探针 a 区域聚合延伸形成 c* 区域,形成的 a+c* 区域在反应温度下与靶标模板动态解离;
ii、探针延伸形成的 c*区域与探针原有序列 c区域互补配对,b区域核苷酸序列通过减少空间位阻协助成环,形成自身茎环结构形式的cDNA;
iii、同时,靶标模板得到释放,参与下一轮逆转录反应。
6.根据权利要求5所述利用线性探针检测靶标miRNA的方法,其特征在于:所述方法还包括检测扩增产物的步骤,所述检测扩增产物的方法包括荧光染料检测法、分子信标检测法或Taqman探针检测法。
7.根据权利要求5所述利用线性探针检测靶标miRNA的方法,其特征在于:所述miRNA包括合成的miRNA、从细胞或组织中提取的含miRNA样品或含有miRNA的提取液。
8.一种利用线性探针检测靶标核酸的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括权利要求1~4任一所述的线性探针。
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