[发明专利]一种血液肿瘤染色体核型自动分析方法及系统在审
申请号: | 202110681605.1 | 申请日: | 2021-06-18 |
公开(公告)号: | CN113435285A | 公开(公告)日: | 2021-09-24 |
发明(设计)人: | 郑永江 | 申请(专利权)人: | 中山大学附属第三医院(中山大学肝脏病医院);中山大学 |
主分类号: | G06K9/00 | 分类号: | G06K9/00;G06K9/62;G06T7/12;G06T7/13;G06T7/136;G06T7/194 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 刘俊 |
地址: | 510620 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 血液 肿瘤 染色体 核型 自动 分析 方法 系统 | ||
1.一种血液肿瘤染色体核型自动分析方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1:采集染色体图像;
S2:对采集的染色体图像进行预处理;
S3:根据预处理得到的染色体图像对染色体进行分割;
S4:对分割完成的染色体进行特征参数的提取;
S5:根据特征参数的提取结果,对染色体进行分类,完成染色体核型自动分析。
2.根据权利要求1所述的一种血液肿瘤染色体核型自动分析方法,其特征在于,在所述步骤S2中,所述预处理包括灰度变换、图像滤波、图像分割、边缘检测与边界跟踪;其中:
所述灰度变换采用线性单值函数公式进行变换,具体表示为:
由于少部分像素分布在小于a和大于b的区间内,此时可用下式作变换:
其中,原染色体图像F(j,k)的灰度范围为[a,b],线性变换后图像F'(j,k)的范围为[a',b'];
图像滤波采用中值滤波法:对窗口内的所有像素的灰度值进行排序,取排序结果的中间值作为原窗口中心点处的像素的灰度值;
图像分割采用灰度阈值分割法,并应用迭代法选取阈值;
边缘检测采用Sobel算子算法进行处理;
所述边界跟踪采用Freeman链码跟踪算法处理。
3.根据权利要求2所述的一种血液肿瘤染色体核型自动分析方法,其特征在于,在所述步骤S3中,所述对染色体进行分割具体包括以下步骤:
S31:采用三点链码计算方法寻找染色体边界凹点以作为候选分割点,具体为:
第一步,求相对链码RelativeCode[i],即出该点的链码值减去进入该点的链码值;
第二步,求绝对链码AbsoluteCode[i],即将前一点的绝对链码加上当前点的相对链码;
第三步,求相对链码和SumCode[i],即将当前点与相邻前两点的绝对链码和相加;
第四步,求链码差DiffCode[i],即将当前点的后第三个点的链码和减去当前点的链码和;
当链码差小于0时,表示该点为凹点,且负值越小越凹陷,当链码差大于0时,表示该点为凸点,且正值越大越凸出;
S32:通过链码差的阈值判断寻找合适的分割点,具体计算过程为:
Dk={i|i=0,1,2,…,N}
Ck={j|DiffCode[j]TC,j∈Dk}
其中,Dk表示该条染色体轮廓上每个点的序号集合,Ck为该条染色体所有满足阈值条件的点集,Tc为负值;
S33:连接分割点完成分割,需满足下列阈值条件:
S={(x,y)|L(x,y)<Td∧Arc(x,y)Ta}
其中,S为最终确立的分割点集,L(·)计算两点间的距离,Td为分割路径阈值,Arc(·)计算两点间的弧长,Ta为染色体边界弧长阈值;连接S内每个二元元素所表示的点,完成粘连分割。
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