[发明专利]用于创伤弧菌检测的RAA引物组、crRNA序列及RAA-CRISPR方法在审

专利信息
申请号: 202110601200.2 申请日: 2021-05-31
公开(公告)号: CN113293222A 公开(公告)日: 2021-08-24
发明(设计)人: 肖星星;郑来宝;林子琴;楼永良 申请(专利权)人: 温州医科大学
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/63
代理公司: 温州名创知识产权代理有限公司 33258 代理人: 朱海晓
地址: 325000 浙江省温州市瓯海*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 用于 创伤 弧菌 检测 raa 引物 crrna 序列 crispr 方法
【权利要求书】:

1. 用于创伤弧菌检测的RAA引物组,其特征在于:其为RAA-F1和RAA- R1构成的引物对或RAA-F2和RAA-R2构成的引物对;

RAA-F1的序列如SEQ ID NO.1所示;

RAA- R1的序列如SEQ ID NO.2所示;

RAA-F2的序列如SEQ ID NO.3所示;

RAA-R2的序列如SEQ ID NO.4所示。

2.根据权利要求1所述的用于创伤弧菌检测的RAA引物组,其特征在于:其为RAA-F2和RAA-R2构成的引物对。

3.一种用于创伤弧菌检测的特异性crRNA,其特征在于:其为crRNA1、crRNA2、crRNA3、crRNA4中的一种或多种;

crRNA1的序列如SEQ ID NO.5所示;

crRNA2的序列如SEQ ID NO.6所示;

crRNA3的序列如SEQ ID NO.7所示;

crRNA4的序列如SEQ ID NO.8所示。

4.根据权利要求3所述的用于创伤弧菌检测的特异性crRNA,其特征在于:其为crRNA3和crRNA4的混合。

5.一种用于创伤弧菌检测的试剂盒,其特征在于:包括RAA引物组、特异性crRNA、Cas12a蛋白、荧光探针;

其中RAA引物组为RAA-F1和RAA- R1构成的引物对或RAA-F2和RAA-R2构成的引物对;

RAA-F1的序列如SEQ ID NO.1所示;

RAA- R1的序列如SEQ ID NO.2所示;

RAA-F2的序列如SEQ ID NO.3所示;

RAA-R2的序列如SEQ ID NO.4所示;

特异性crRNA为crRNA1、crRNA2、crRNA3、crRNA4中的一种或多种;

crRNA1的序列如SEQ ID NO.5所示;

crRNA2的序列如SEQ ID NO.6所示;

crRNA3的序列如SEQ ID NO.7所示;

crRNA4的序列如SEQ ID NO.8所示。

6.根据权利要求5所述的用于创伤弧菌检测的试剂盒,其特征在于:其中RAA引物组为RAA-F2和RAA-R2构成的引物对;特异性crRNA为crRNA3和crRNA4的混合。

7.根据权利要求5所述的用于创伤弧菌检测的试剂盒,其特征在于:所述荧光探针为5’6-FAM-TTATT-3’BHQ1。

8.一种创伤弧菌检测方法,其特征在于:其采用如权利要求5-7任一项所述的用于创伤弧菌检测的试剂盒,其包括以下步骤:

(1)对被测试样进行基因组提取,得到待测基因组样品;

(2)采用RAA引物组对待测基因组样品扩增;

(3)将Cas12a蛋白和crRNA,合并于一管,振荡离心后孵育形成核糖核蛋白体,将步骤(2)的产物和荧光探针加入到创伤弧菌检测检测体系中,振荡离心后,切割反应;

(4)检测体系的荧光强度。

9. 根据权利要求8所述的创伤弧菌检测方法,其特征在于:步骤(2)中RAA引物组与待测基因组样品扩增反应的时间为15-30 min。

10. 根据权利要求8所述的创伤弧菌检测方法,其特征在于:步骤(3)中,切割反应为15-30 min。

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