[发明专利]特异性结合CEA的核酸适配体及其应用在审
申请号: | 202110577254.X | 申请日: | 2021-05-26 |
公开(公告)号: | CN113308474A | 公开(公告)日: | 2021-08-27 |
发明(设计)人: | 孔桂美;黄瑶;张小荣;曾凤;叶桐;蔡凌宇;王孝通 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12N15/115 | 分类号: | C12N15/115;C12N15/10;C12N15/11;G01N33/574;A61K31/7088;A61P35/00 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 董建林 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 特异性 结合 cea 核酸 适配体 及其 应用 | ||
1.一种特异性结合CEA的核酸适配体,其特征在于,所述核酸适配体的序列如SEQ IDNO.1所示。
2.根据权利要求1所述的特异性结合CEA的核酸适配体引物,其特征在于,所述引物序列如下:
上游引物:5’-TGCGCTCTAGAGACGAAT-3’;
下游引物:5’-GTATACCTGCAGCTGAGG-3’;
生物素标下游引物:5’–Biotin-GTATACCTGCAGCTGAGG-3’。
3.根据权利要求1所述的特异性结合CEA的核酸适配体筛选方法,其特征在于,将CEA胞外区序列构建入表达载体pDisplay,重组质粒命名为pDisplay-CEA,重组质粒转染Cos-1细胞,经过G418筛选获得稳定表达CEA的细胞株;对称PCR扩增,核酸PAGE电泳,非对称PCR扩增ssDNA;链亲和素-Biotin分离纯化ss DNA;经过筛选使文库富集,采用未标记的引物对其进行PCR扩增后,连接至T载体,测序比对后得到特异性结合CEA的核酸适配体。
4.根据权利要求3所述的特异性结合CEA的核酸适配体筛选方法,其特征在于,原始随机ssDNA文库的序列为:5’-TGCGCTCTAGAGACGAAT-(N)45-CCTCAGCTGCAGGTATAC-3’。
5.根据权利要求3所述的特异性结合CEA的核酸适配体筛选方法,其特征在于,链亲和素-Biotin分离纯化ss DNA的步骤为:磁珠预处理;将非对称PCR产物至磁珠中,轻轻上下颠倒混匀,室温摇床孵育,磁力架上收集上清;用DNA抽提试剂抽提,吸出上清,剧烈混匀,离心取上清;上清用无水乙醇进行沉淀,离心后弃上清;乙醇清洗DNA,离心弃上清,再瞬离,吸干上清,再吹干;经过4轮阳性筛选后,加入反向筛选。
6.根据权利要求3所述的特异性结合CEA的核酸适配体筛选方法,其特征在于,ssDNA文库经过预处理,其步骤为:将ssDNA文库加TE溶解,浓度为100μM,取5nmol,95℃10min变性后迅速放冰中致冷至0℃,冰中放置10min以上。
7.根据权利要求1所述的特异性结合CEA的核酸适配体鉴定方法,其特征在于,将核酸适配体水浴活化后,将其加入高表达CEA的肿瘤细胞中,室温孵育,DAB显色试剂盒显色,在显微镜下观察细胞颜色。
8.一种检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒含有如权利要求1所述核酸适配体。
9.根据权利要求1所述的特异性结合CEA的核酸适配体在制备肿瘤检测试剂或肿瘤治疗药物中的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述肿瘤为大肠癌、胰腺癌、胃癌、乳腺癌、甲状腺髓样癌、肝癌、肺癌、卵巢癌、泌尿系肿瘤或结肠癌。
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