[发明专利]胰腺癌相关的lncRNA标志物、探针及检测试剂盒在胰腺癌诊断中的应用

说明书

本发明公开了胰腺癌相关的lncRNA标志物、探针及检测试剂盒在胰腺癌诊断中的应用，属于基因工程生物技术领域。所述的lncRNA组合为：CASC2、PVT1以及内参GAPDH；所述CASC2为如SEQ.ID.NO.1和SEQ.ID.NO.2所示的引物序列以及SEQ.ID.NO.3所示的探针核苷酸序列；所述PVT1为如SEQ.ID.NO.4和SEQ.ID.NO.5所示的引物序列以及SEQ.ID.NO.6所示的探针核苷酸序列；所述GAPDH为如SEQ.ID.NO.7和SEQ.ID.NO.8所示的引物序列以及SEQ.ID.NO.9所示的探针核苷酸序列。本发明上述lncRNA组合可作为胰腺癌诊断标志物：CASC2和PVT1。检测出所述标记物PVT1、CASC2在胰腺癌患者组织中低表达。本发明提供的标记物可应用于制备胰腺癌早期评估产品中，有利于进一步阐明胰腺癌发病机制，并为发现具有潜在治疗价值的新型小分子药物靶标提供帮助。

技术领域

本发明涉及胰腺癌相关的lncRNA标志物、探针及检测试剂盒在胰腺癌诊断中的应用，属于基因工程生物技术领域。

背景技术

胰腺癌是最常见的消化道恶性肿瘤之一，主要起源于胰腺导管上皮和腺泡细胞。预计到2030年，胰腺癌将成为癌症相关死亡的第二大诱因，甚至在某些地区跃升为头号癌症杀手。据中国国家癌症中心2018年发布的居民癌症数据显示，我国胰腺癌发病率排名第10，死亡率排名第5，5年相对存活率仅为7.2％。胰腺癌患者缺乏早期症状或症状不典型，多数患者就诊时疾病已经进入晚期阶段，往往已丧失手术时机。由于肿瘤细胞已经扩散到胰腺外且对化疗药物耐药，导致传统非手术疗法通常无效。尽管成像技术和肿瘤标志物筛查已经取得了一些进展，但由于缺乏精准可靠观察指标，胰腺癌早期诊断仍面临极大挑战。因此，筛查敏感有效的生物标志物，提高胰腺癌早期诊断水平，是改善胰腺癌预后的一个关键因素。

目前，血清糖类抗原19-9(Carbohydrate antigen19-9,CA19-9)是美国食品药品监督管理局批准的唯一的胰腺癌诊断标记物。但CA19-9并不是胰腺癌独有的，其对宿主的炎症反应和阻塞性黄疸也很敏感。因此，现迫切需要一种操作简便且特异性及灵敏度均较高的早期评估方法。

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)通常被定义为超过200个核苷酸的非蛋白质RNA转录本。基于高通量测序技术，遗传研究在哺乳动物中发现了成千上万的表达lncRNA转录本的基因位点。目前在人和小鼠中鉴定出的lncRNA的数量分别为172,216和131,697，远远超过了鉴定出的经典蛋白质的数量，并且预计lncRNA的数量还将继续增加。在各种组织和疾病中观察到的不同lncRNA表达模式，可以在发育和病生理环境中调控多种重要的信号转导，并可以表观遗传调控等方式影响肿瘤细胞生长、凋亡、耐药与转移。越来越多的证据显示，胰腺组织lncRNA异常表达与胰腺内、外分泌功能不全以及癌症进展密切相关。lncRNA标记物在胰腺癌调控机制中的研究目前正处于起步阶段。因此，探索lncRNA单独或组合作为胰腺癌早期筛查标记物，不仅对胰腺癌早期诊断具有重要作用，还能为胰腺癌基因靶向治疗提供参考。

发明内容

本发明的主要目的是针对上述问题，提出一组与胰腺癌相关的lncRNA标志物、以及LncRNA标志物在制备胰腺癌诊断试剂盒中的应用。

为实现上述目的，本发明采用以下技术方案：

本发明提供了一组与胰腺癌相关的lncRNA标志物组合，所述的lncRNA标志物组合为：CASC2和PVT1；所述CASC2的引物序列如SEQ.ID.NO.1和SEQ.ID.NO.2所示；所述PVT1的引物序列如SEQ.ID.NO.4和SEQ.ID.NO.5所示。

本发明提供了一系列基于胰腺癌相关的lncRNA标志物的探针，所述探针能特异性捕获包括权利要求1所述的lncRNA标志物。该探针是由上海生工生物工程股份有限公司定制合成的TaqMan探针。