[发明专利]基于熵驱动的可视miRNA生物传感器及其应用在审
申请号: | 202110313844.1 | 申请日: | 2021-03-24 |
公开(公告)号: | CN113201581A | 公开(公告)日: | 2021-08-03 |
发明(设计)人: | 朱莎;冯宁翰;冯杨焜;柳丰萍;汪洋;蒋鹏;张丽莉 | 申请(专利权)人: | 无锡市第二人民医院 |
主分类号: | C12Q1/6825 | 分类号: | C12Q1/6825;C12Q1/682;C12N15/11 |
代理公司: | 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 | 代理人: | 项凯 |
地址: | 214000 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 驱动 可视 mirna 生物 传感器 及其 应用 | ||
1.一种生物传感器,所述生物传感器用于检测样本中的靶标物,所述靶标物包括靶标RNA或靶标DNA,其特征在于,所述生物传感器包括由DNA1、DNA2和DNA3杂交而成的三链复合物1,燃料链,修饰有若干ssDNA5的金纳米颗粒5,以及,修饰有若干ssDNA6的金纳米颗粒6;所述DNA3依次含有粘性末端,与DNA1互补的第一互补区域,以及,与DNA2互补的第二互补区域,其中,粘性末端用于与靶标物结合来触发熵驱动扩增反应,使得靶标物、DNA2和DNA3杂交形成三链复合物2,同时,使得DNA3上暴露出一个能够与燃料链结合的粘性区域;所述燃料链与DNA3互补,使得粘性区域与燃料链结合后,三链复合物2的DNA2能够被释放;所述ssDNA5和ssDNA6分别与DNA2的不同区域互补,使得DNA2被释放后,修饰有若干ssDNA5的金纳米颗粒5和修饰有若干ssDNA6的金纳米颗粒6能够通过ssDNA5和ssDNA6与DNA2互补序列间的杂交诱导发生聚集;
或者,所述生物传感器包括由DNA1、DNA2和DNA3杂交而成的三链复合物,燃料链,DNA探针链,修饰有若干ssDNA1的金纳米颗粒1,修饰有若干ssDNA2的金纳米颗粒2,修饰有若干ssDNA3的金纳米颗粒3,以及,修饰有若干ssDNA4的金纳米颗粒4;所述DNA3依次含有粘性末端,与DNA1互补的第一互补区域,以及,与DNA2互补的第二互补区域,其中,粘性末端用于与靶标物结合来触发熵驱动扩增反应,使得靶标物、DNA2和DNA3杂交形成三链复合物2,同时,使得DNA3上暴露出一个能够与燃料链结合的粘性区域;所述燃料链与DNA3互补,使得粘性区域与燃料链结合后,三链复合物2的DNA2能够被释放;所述DNA探针链用于与DNA2杂交形成含有内切酶识别区域的双链DNA,在内切酶的作用下,双链DNA至少能够释放出游离DNA片段1和游离DNA片段2;所述ssDNA1和ssDNA2分别与游离DNA片段1的不同区域互补,使得游离DNA片段1被释放后,修饰有若干ssDNA1的金纳米颗粒1和修饰有若干ssDNA2的金纳米颗粒2能够通过ssDNA1和ssDNA2与游离DNA片段1互补序列间的杂交诱导发生聚集;所述ssDNA3和ssDNA4分别与游离DNA片段2的不同区域互补,使得游离DNA片段2被释放后,修饰有若干ssDNA3的金纳米颗粒3和修饰有若干ssDNA4的金纳米颗粒4能够通过ssDNA3和ssDNA4与游离DNA片段2互补序列间的杂交诱导发生聚集。
2.如权利要求1所述的生物传感器,其特征在于,所述粘性区域位于靶标物和DNA2之间。
3.如权利要求1或2所述的生物传感器,其特征在于,所述DNA探针链为发夹型DNA探针链;所述内切酶为切刻内切酶;所述发夹型DNA探针链用于与DNA2杂交形成含有切刻内切酶识别区域的双链DNA,在切刻内切酶的作用下,双链DNA能够释放出游离DNA片段1和游离DNA片段2。
4.如权利要求1~3任一项所述的生物传感器,其特征在于,所述靶标RNA包括靶标miRNA;所述靶标miRNA包括let-7a、miRNA-141、miRNA-145、miRNA-21或miRNA-25。
5.如权利要求4所述的生物传感器,其特征在于,当靶标miRNA为let-7a时,所述DNA1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述DNA2的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,所述DNA3的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述燃料链的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示,所述发夹型DNA探针链的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示,所述ssDNA1的核苷酸序列如SEQ ID NO:6所示,所述ssDNA2的核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示,所述ssDNA3的核苷酸序列如SEQ IDNO:8所示,所述ssDNA4的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示。
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