[发明专利]分子骨架跃迁的处理方法、装置、介质及电子设备

说明书

本申请的实施例提供了一种分子骨架跃迁的处理方法、装置、介质及电子设备。该分子骨架跃迁的处理方法包括：根据参考药物分子对应的连接图结构生成所述参考药物分子对应的原子隐向量；对所述原子隐向量进行原子遮挡处理，以获取到所述原子隐向量中包含的骨架隐向量和侧链隐向量；根据所述骨架隐向量的空间分布，生成与所述骨架隐向量之间具有指定跃迁度的目标骨架隐向量；根据所述目标骨架隐向量和所述侧链隐向量生成跃迁后的药物分子。本申请实施例的技术方案可以提高新生成药物分子的新颖性。

技术领域

本申请涉及计算机及通信技术领域，具体而言，涉及一种分子骨架跃迁的处理方法、装置、介质及电子设备。

背景技术

骨架跃迁是非常重要的药化设计工具，其目的主要是期望改变现有专利保护的分子结构、替换复杂天然产物的局部结构、通过改变分子的骨架来改善分子的药代动力学性质。相关技术中的骨架跃迁方案主要是基于药效团模型、分子形状相似搜索等方案，然而这些方案由于都是基于规则的生成，很难跳出药化专家的设计思路，导致跃迁后的分子新颖性不足。

发明内容

本申请的实施例提供了一种分子骨架跃迁的处理方法、装置、介质及电子设备，进而至少在一定程度上可以提高新生成药物分子的新颖性。

本申请的其他特性和优点将通过下面的详细描述变得显然，或部分地通过本申请的实践而习得。

根据本申请实施例的一个方面，提供了一种分子骨架跃迁的处理方法，包括：根据参考药物分子对应的连接图结构生成所述参考药物分子对应的原子隐向量；对所述原子隐向量进行原子遮挡处理，以获取到所述原子隐向量中包含的骨架隐向量和侧链隐向量；根据所述骨架隐向量的空间分布，生成与所述骨架隐向量之间具有指定跃迁度的目标骨架隐向量；根据所述目标骨架隐向量和所述侧链隐向量生成跃迁后的药物分子。

根据本申请实施例的一个方面，提供了一种分子骨架跃迁的处理装置，包括：第一生成单元，配置为根据参考药物分子对应的连接图结构生成所述参考药物分子对应的原子隐向量；第一处理单元，配置为对所述原子隐向量进行原子遮挡处理，以获取到所述原子隐向量中包含的骨架隐向量和侧链隐向量；第二生成单元，配置为根据所述骨架隐向量的空间分布，生成与所述骨架隐向量之间具有指定跃迁度的目标骨架隐向量；第三生成单元，配置为根据所述目标骨架隐向量和所述侧链隐向量生成跃迁后的药物分子。

在本申请的一些实施例中，基于前述方案，所述连接图结构中的节点表示所述参考药物分子中的原子；所述第一生成单元配置为：基于所述连接图结构中包含的节点特征和边特征，通过图编码器计算所述连接图结构中各个节点的节点信息，所述节点特征表示所述参考药物分子中的原子特征，所述边特征表示所述参考药物分子中的原子之间的特征；根据所述各个节点的节点信息和所述各个节点的节点特征，生成所述各个节点的隐向量；根据所述各个节点的隐向量和所述参考药物分子所包含的原子，生成所述参考药物分子对应的原子隐向量。

在本申请的一些实施例中，基于前述方案，所述第一生成单元配置为：根据所述连接图结构中的第一节点的节点特征、所述连接图结构中的第二节点的节点特征，以及所述第一节点的邻居节点中除所述第二节点之外的其它节点与所述第一节点之间在前一隐藏层中的边信息，计算所述第一节点与所述第二节点之间在后一隐藏层中的信息，所述第一节点是所述连接图结构中的任一节点，所述第二节点是所述第一节点在所述连接图结构中的邻居节点；

根据所述第一节点与所述第二节点之间在前一隐藏层中的边信息，以及所述第一节点与所述第二节点之间在后一隐藏层中的信息，计算所述第一节点与所述第二节点之间在后一隐藏层中的边信息；其中，所述连接图结构中的两个节点之间在初始隐藏层中的边信息为根据所述两个节点中的一个节点的节点特征，以及所述两个节点之间的边特征计算得到；对各个节点在所有隐藏层中对应的边信息进行求和，得到所述各个节点的节点信息。