[发明专利]一种基于铁死亡进程的肝细胞癌分型体系的构建方法

说明书

本发明公开了一种基于铁死亡进程的肝细胞癌分型体系的构建方法，包括如下步骤：步骤一、探索FRGs在HCC中的表达情况：首先分别纳入来自于GEO，TCGA和ICGC数据库的32个数据集共3933个肝细胞癌样本。本发明通过探索FRGs在HCC中的表达情况、异质性铁死亡亚型的识别和验证、两亚型的临床状态、评估FRRS在预测预后和免疫治疗疗效上的表现以及HCCS程序包的开发的步骤配合，共纳入了32个数据集的3933个肝癌样本进行分析，分为低铁死亡亚型和高铁死亡亚型，并显示出了特异的功能特征和临床结局，此外，基于铁死亡分型，还提出了一个铁死亡相关风险评分(FRRS)，FRRS在预测预后和免疫治疗来疗效中都展示了较好的效果，可为铁死亡在肝癌中的研究奠定了基础。

技术领域

本发明涉及原发性肝癌技术领域，具体为一种基于铁死亡进程的肝细胞癌分型体系的构建方法。

背景技术

原发性肝癌(primary liver cancer)是世界上第五常见的恶性肿瘤，在肿瘤相关死亡的原因中位列第四，每年约有84万的新发病例，其中，肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma，HCC)是其重要是组织学类型(占其75％-85％)，具有高侵袭性和高致死率的特点，早期肝癌多采取手术切除，但肝癌切除术后5年复发率仍高达70％，且大多数患者于术后2年内复发，不可切除的肝细胞癌(HCC)患者通常接受多激酶抑制剂索拉非尼或轮伐替尼，然而药物耐药及不良反应使得患者的生存获益受限，近年来，以免疫检查点抑制剂(ICIs) 为代表的免疫治疗取得了很大进展，然而HCC生物学行为的异质性导致仅有25％的患者产生持久的治疗反应，尽管其他治疗方式如消融治疗、经导管肝动脉化疗栓塞术(TACE)也取得了很大进展，但高的复发率使得HCC患者5年生存率仅有18％。

铁死亡是一种新发现的，以铁依赖性脂质过氧化和活性氧诱导的程序性细胞死亡为特征，区别于典型的细胞凋亡、自噬和程序性坏死等的新型细胞死亡方式，索拉菲尼既是晚期HCC的一线用药，也可通过抑制system Xc^-进而导致GSH耗竭诱导铁死亡来治疗肝细胞癌，已有研究证实在索拉非尼诱导细胞死亡的过程中，治疗精神病的药物氟哌啶醇可以增强索拉非尼诱导的HCC的铁死亡，除铁代谢外，脂质代谢也在肝细胞癌的铁死亡中起重要作用，然后目前对 HCC铁死亡的研究大多还停留在细胞和动物水平，缺乏大样本、多组学的系统化深入研究。

因此亟需设计一种基于铁死亡进程的肝细胞癌分型体系的构建方法来解决上述问题。

发明内容

本发明的目的在于提供一种基于铁死亡进程的肝细胞癌分型体系的构建方法，以解决上述背景技术中提出的现有HCC铁死亡的研究大多还停留在细胞和动物水平，缺乏大样本、多组学的系统化深入研究的问题。

为实现上述目的，本发明提供如下技术方案：一种基于铁死亡进程的肝细胞癌分型体系的构建方法，包括如下步骤：

步骤一、探索FRGs在HCC中的表达情况：首先分别纳入来自于 GEO，TCGA和ICGC数据库的32个数据集共3933个肝细胞癌样本，且32个数据集分别为GSE102079，GSE107170，GSE109211， GSE112790，GSE116174，GSE121248，GSE14323，NCI，GSE16757， GSE19977，GSE20017，GSE25097，GSE36376，GSE36411， GSE39791，GSE43619，GSE45436，GSE46444，GSE50579， GSE54236，GSE57957，GSE62043，GSE62232，GSE63898， GSE64041，GSE76297，GSE76427，GSE84005，GSE87630，GSE9843， TCGA-LIHC和ICGC-LIRI-JP，其中NCI TCGA-LIHC和ICHC-LIRI-JP 具有完整的表达信息和临床预后信息；