[发明专利]一种遗传性结直肠癌的检测panel及检测试剂盒

说明书

本发明属于结直肠癌检测技术领域，公开了一种遗传性结直肠癌的检测panel及检测试剂盒，检测panel中包括林奇综合征、家族性腺瘤性息肉病、MUTYH‑相关息肉病、少年息肉病综合征、多发性错构瘤综合征、黑斑息肉综合征、锯齿状息肉病综合征、聚合酶校对功能相关息肉病、佛美尼综合症、常染色体隐性息肉病、遗传性乳腺癌、卵巢癌总而后者、家族性非典型多痣黑色素瘤综合征、遗传性弥漫性胃癌综合征、高/中度外显基因等相关基因。同时，试剂盒中包括检测panel中的检测试剂及其他成分。通过判断本发明提供的panel中各个基因的存在情况以及存在量，可进一步得知受试者的患病风险，从而达到早期监测早期防治的目的。

技术领域

本发明属于结直肠癌诊断技术领域，涉及ZNF408在乳腺癌诊断和预后评估中的应用。

背景技术

结直肠癌(后简称肠癌)是我国发病率和致死率最高的恶性肿瘤之一，其中遗传性肠癌的比例约为10％～15％。我国流行病学统计结果显示，约20％～30％的肠癌患者有家族病史。遗传性肠癌与散发性肠癌的区别在于前者是因携带可遗传的致病性胚系基因突变所致，大多为抑癌基因突变导致的编码蛋白表达下调，因此，患者及其家系中的突变携带者罹患肠癌的风险显著高于正常人群。由于致病基因不同，遗传性肠癌分为多种亚型，其中以林奇综合征为常见，即遗传性非息肉病性肠癌，约占总体肠癌数量的3％～5％。其次，家族性腺瘤性息肉病约占1％～2％，其它还包括黑斑息肉病、少年息肉病综合征、MUTYH-相关息肉病，聚合酶校对功能相关息肉病等近10中较为少见的亚型。

遗传性肠癌最大特征在于致病突变携带者所在家系成员的肠癌高度易感性呈现出的显著家族性肠癌聚集，另外高风险早发性(50岁)肠癌和多原发肠癌常见。就林奇综合征而言，致病性错配修复基因(MLH1、MSH2、MSH6、PMS2)突变携带者终生罹患肠癌的风险高达70％～75％。除结直肠外，林奇综合征患者罹患胃癌、小肠癌、子宫内膜癌、卵巢癌、胰腺癌、乳腺癌的风险显著高于普通人群，有研究显示，约30％患者罹患肠外恶性肿瘤。家族性腺瘤性息肉病患者多在15岁前后出现息肉，如不进行任何预防性治疗，癌变的外显率几乎为100％。其他遗传性肠癌综合征均表现在高风险的早发性肠癌或多发肠息肉病。

Lynch综合征的病因已明确，系错配修复基因和EPCAM的胚系致病性突变所致，以常染色体显性方式遗传。家族性腺瘤性息肉病是由于APC基因突变引起的常染色体显性遗传病，其经典表型以结直肠中发生成百上千枚腺瘤性息肉为特征。MUTYH-相关息肉病则因MUTYH双等位基因突变所致，临床表型的异质性大，可出现严重的息肉病、较晚发病的衰减息肉病、甚至仅少量腺瘤。聚合酶校对功能相关息肉病因聚合酶校正基因POLE和POLD1的核酸外切酶结构域编码基因突变所致，可导致结直肠衰减型息肉病和早发性肠癌。除此之外，一些其他基因如：BRCA1、BRCA2、RAD50、TP53，PTEN，STK11，CDH1，CHEK2，ATM等一系列易感基因的突变也被证明与遗传性结直肠癌相关。

通过基因检测发现致病性的胚系突变，是诊断遗传性肠癌的金标准。近年来二代测序技术不断精进，尤其是Illumina测序平台已逐渐普及到国内，愈来愈多高风险罹患遗传肠癌的患者和受累家系接受了基因检测，遗传性肠癌的确诊率较前显著提高。

但是，本领域仍然需要进一步地优化遗传性结直肠癌的诊断试剂或试剂盒，以更为便捷的技术实现更为精密的检测。

发明内容

本发明的目的在于提供遗传性结直肠癌易感基因检测panel、检测试剂盒和该试剂盒的应用。本发明人经过深入的研究，选择了遗传性结直肠癌相关的具有代表性的多个基因，基于所选择的这些基因进行适于扩增的引物设计。所述多基因检测的意义远不限于基于个体和其家族进行的临床建议，更能推动癌症筛查和(或)癌症预防的临床建议的优化。