[发明专利]一种基于级联门控3DUnet模型的CT图像肾脏肿瘤分割方法有效
申请号: | 202110141339.3 | 申请日: | 2021-02-02 |
公开(公告)号: | CN112767407B | 公开(公告)日: | 2023-07-07 |
发明(设计)人: | 孙玉宝;吴敏;徐宏伟;刘青山;辛宇 | 申请(专利权)人: | 南京信息工程大学 |
主分类号: | G06T7/10 | 分类号: | G06T7/10;G06T7/13;G06T3/40;G06N3/08;G06N3/0464 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 刘莎 |
地址: | 210044 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 级联 门控 dunet 模型 ct 图像 肾脏 肿瘤 分割 方法 | ||
本发明公开了一种基于级联门控3DUnet模型的CT图像肾脏肿瘤分割方法,包括:采集腹部CT扫描中包含肾脏的图像序列,对每个图像序列中的肾脏及肿瘤进行标注,生成对应的标注掩码,构建数据集Dataset;对Dataset进行P1预处理操作,构建肾脏(包括肿瘤)分割的U型深度网络模型M1;对Dataset中的图像序列与对应的标注掩码进行裁剪,取出只有肾脏(或肿瘤)的体素部分,进行P2预处理操作,基于门控卷积层构建肿瘤分割的深度网络分割模型M2;分别对模型M1、M2进行训练;通过模型M1和M2的级联处理分割出肾脏肿瘤区域。本发明通过网络级联的两阶段分割模型,并联合门控卷积层构建了用于肿瘤分割的深度网络模型,能够对癌变肾脏的形状变化保持鲁棒,有效分割出不同尺寸的肿瘤。
所属技术领域
本发明涉及计算机、软件类以及人工智能技术等领域,尤其涉及基于级联门控3DUnet模型的CT图像肾脏肿瘤分割方法。
背景技术
医学图像成像技术在科学技术的迅速发展中取得了巨大的进步,该技术集现代医学、物理学、电子信息和计算机技术等诸多技术于一体,已经成为医学领域不可或缺的重要手段。计算机断层扫描(Computed Tomography,简称CT)是当前广泛使用的医学成像方式,能够准确全面地描述人体器官、组织和病灶的详细特征,使得专业医师能够更直接、更清晰地对病变部位进行非侵入式观察,以便及时制定有效的治疗方案,从而提高疾病的确诊效率和治愈率。肾脏是泌尿系统的关键组成部分,担任着调节酸碱平衡和新陈代谢等重要功能,由于人们生活节奏的加快和工作压力的增大,导致各种肾脏疾病不断增加。肾肿瘤是常见的肾脏疾病,即“肾癌”,也叫肾细胞癌,起源于肾上皮的恶性肿瘤,其病理类型复杂,临床表现殊异。相比于其他医学成像方式,CT图像能够在较好地呈现和区分出肾癌的病变特性,成为医生对肾脏疾病进行初步诊断和后续跟进的重要依据。
在临床治疗中,准确分割出肾脏和病变区域对于病情诊断,功能评估和治疗决策非常重要。早期的分割工作是由有经验的医生手动勾画的,这种分割方式主观性强、效率低并且分割结果无法复现,不能很好地满足临床要求,已经无法满足当前的定量诊断需求。随着现代科学技术的发展,使得利用计算机技术实现医学图像分割成为可能,研究人员开始纷纷探索自动分割的方法。然而,准确可靠地分割出CT图像中的肾脏存在一些难点,比如:CT图像对比度低,肾脏与相邻的器官和组织之间边界模糊,个体形状存在差异,肾脏内部的水和空气容易引起噪声和空洞等。对于肾癌患者而言,由于肿瘤尺寸多样,且与正常肾脏组织像素值相近,以致边界难以区分,使得分割CT图像中的肾脏肿瘤存在诸多挑战。因此,开发用于CT图像中的肾脏肿瘤的全自动分割算法有着很实际的研究意义。
目前,深度学习在各个领域均取得了显著的成果,其优越性得益于卷积神经网络能够自动提取特征的能力,使得深度学习模型能够普遍适用于不同任务,并且这种优势随着相关理论的不断深入表现地越来越明显,使之迅速发展成大数据时代的主流技术。近年来,用于医学图像分割的深度学习模型逐渐出现在当前的研究之中。虽然卷积神经网络能够自动提取有效的特征,但是针对CT图像肾脏肿瘤分割问题,仍存在对于肾脏形态变化不够鲁棒,以及肿瘤分割不够准确等问题。建立图像肾脏肿瘤的精确分割模型可为临床提供定量诊断依据,辅助医生决策,具有重要的临床意义和良好的应用前景。
发明目的:
本发明所要解决的技术问题在于CT图像肾脏及其肿瘤分割,提出基于级联门控三维全卷积网络3DUnet模型的肾脏肿瘤分割算法,实现CT图像序列中的肾脏肿瘤区域的准确分割。
技术方案:
为解决上述技术问题,本发明提供了一种基于级联门控3DUnet模型的肾脏肿瘤分割算法,其技术方案如下:
一种基于级联门控3DUnet模型的CT图像肾脏肿瘤分割方法,包括如下具体步骤:
S101,采集腹部CT扫描中包含肾脏的图像,取出包含肾脏或肿瘤的切片图像构成图像序列,利用标注软件对每个切片图像中的肾脏及肿瘤进行标注,生成对应的标注掩码,构建数据集Dataset;
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