[发明专利]一种快速检测单增李斯特菌的试剂盒及其制备方法和检测方法在审
申请号: | 202110107000.1 | 申请日: | 2021-01-27 |
公开(公告)号: | CN112553305A | 公开(公告)日: | 2021-03-26 |
发明(设计)人: | 贾利蓉;曾红棱;邓锐杰;任尧 | 申请(专利权)人: | 四川大学 |
主分类号: | C12Q1/6816 | 分类号: | C12Q1/6816;C12Q1/06 |
代理公司: | 成都中亚专利代理有限公司 51126 | 代理人: | 赵婷;何渊 |
地址: | 610065 四川省*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 李斯特 试剂盒 及其 制备 方法 | ||
1.一种快速检测单增李斯特菌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括CRISPR-Cas检测体系,具体包括:分子识别剂;信号转换剂;转录体系;以及缓冲液;
其中,所述分子识别剂包括:Cas蛋白和L-crRNA ,L-crRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述信号转换试剂包括L-Broccoli和荧光染料,L-Broccoli的核苷酸序列如SEQ IDNO:2所示;所述转录体系包括启动子、phi29 DNA聚合酶、T7 RNA聚合酶、dNTPs、rNTPs、DNase I,启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述缓冲液包含10×phi 29聚合酶缓冲液和5×转录缓冲液;其中,所述10×phi 29聚合酶缓冲液的组成分为:33 mM Tris-醋酸盐、10 mM醋酸镁、66mM醋酸钾、0.1%(v / v)吐温 20、1 mM DTT;所述5×转录缓冲液的组分为200 mM Tris-HCl、30 mM MgCl2、 50 mM DTT、50 mM NaCl 、 10 mM 亚精胺 。
3.一种制备如权利要求1或2所述的快速检测单增李斯特菌的试剂盒的方法,其特征在于,该方法包含Broccoli适体的制备和crRNA的制备,所述Broccoli适体的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示,所述crRNA的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述Broccoli适体的制备方法包含:取5µL浓度为1~10 µM的 L-Broccoli、5 µL浓度为1~10 µM的启动子以及5µL 10×phi29聚合酶缓冲液混匀,在80~90℃变性3~5分钟,然后室温反应5~30分钟;
再加入0.2~0.5 µL浓度为10 U / µL的 phi 29 DNA聚合酶和1~5 µL dNTPs,在30℃下孵育10~60min, 孵育使其延伸形成双链;
再加入1~4 µL 浓度为20 U / µL 的T7 RNA聚合酶、5µL 5×转录缓冲液、2 µL rNTPs和水,37℃孵育1~6小时,转录结束后,加入2µL DNase I孵育去除DNA模板,灭活后即得到Broccoli适体。
5.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述crRNA的制备方法包含:取5µL浓度为1~10 µM 的L-crRNA、5 µL 浓度为1~10 µM 的启动子以及5µL 10× phi 29聚合酶缓冲液混匀,80~90℃变性3~5分钟,然后室温反应5~30分钟;
再加入0.2~0.5 µL 浓度为10 U / µL 的phi 29 DNA聚合酶和1~5 µL dNTPs,30℃孵育10~60min, 孵育使其延伸形成双链;
再加入10 µL 浓度为20 U / µL 的1~4 µL T7 RNA聚合酶、5µL 5×转录缓冲液,2 µLrNTPs和水,37℃孵育1~6小时,转录结束后,加入2µL DNase I孵育去除DNA模板,然后灭活即得到crRNA适体。
6.一种采用如权利要求3~5任一所述的方法制备得到的快速检测单增李斯特菌的试剂盒。
7.一种单增李斯特菌的的快速检测方法,其特征在于,使用如权利要求1~2、6任一所述的试剂盒进行检测,该检测方法包含以下步骤:
(1)提取单增李斯特菌靶标RNA:采用细菌总RNA分离试剂盒提取纯化总RNA,并测定RNA浓度;
(2) 单增李斯特菌的检测:将步骤(1)中的靶标RNA,与Broccoli适体、荧光染料、crRNA和Cas蛋白混匀,孵育后检测荧光;
(3)建立单增李斯特菌浓度与荧光强度的标准曲线:将不同浓度靶标RNA,Broccoli、荧光染料、crRNA和和Cas蛋白混匀,孵育后检测荧光,根据荧光结果绘制单增李斯特菌浓度与荧光强度的标准曲线。
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