[发明专利]一种检测膀胱癌的试剂盒有效

专利信息
申请号: 202110059310.0 申请日: 2021-01-15
公开(公告)号: CN112680522B 公开(公告)日: 2023-03-17
发明(设计)人: 徐清华;吴益旺;孙益丰;宋凯斌;任婉丽;陈金影;胡林义 申请(专利权)人: 杭州可帮基因科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;G16B40/00;G16B5/00;G16B20/00
代理公司: 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 代理人: 李高峡;张娟
地址: 311199 浙江省杭州市余杭*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 膀胱癌 试剂盒
【说明书】:

本发明公开了一种检测膀胱癌的试剂盒,属于癌症诊断试剂领域。本发明的试剂盒包括检测尿液脱落细胞中CA9、CCL18、ERBB2、IGF2、LINC00565、MMP12、PPP1R14D和SGK2等8个基因表达水平的试剂。本发明还公开了一种膀胱癌检测系统,该系统通过机器学习算法基于前述8个基因的表达量得到区分膀胱癌和非膀胱癌的二分类模型,可对膀胱癌实现高准确率的诊断。该系统与现有技术同等准确率的条件下,大幅度减少用于膀胱癌诊断的基因数量,显著降低了检测费用,缩短了检测所需时间,更加方便医疗机构开展,从而能够较好地满足临床对于无创膀胱癌检查的迫切需求。

技术领域

本发明属于癌症诊断试剂领域。

背景技术

膀胱癌是指起源于膀胱的恶性肿瘤,是泌尿系统常见癌症之一。膀胱癌患者中,男性是女性的3~4倍。膀胱癌可发生于任何年龄,多发生于50岁以上。膀胱癌的发生发展是多因素、多步骤复杂变化的过程,目前认为与遗传易感性、吸烟、职业暴露、饮食、长期使用某些药物等有关。

遗传易感性是膀胱癌发生发展的重要因素,目前已经报道了较多相关基因。例如:GSTM1缺失1拷贝和2拷贝患膀胱癌风险分别增加1.2、1.9倍;GSTP1基因第105位密码子若为缬氨酸则会增加膀胱癌的易感性,尤其是高级别或浸润性膀胱癌;GSTT1基因缺失会降低机体对致癌物质的解毒作用,增加患膀胱癌的风险。

CA9(carbonic anhydrase 9,GeneID:768)是一种编码催化二氧化碳可逆水合的锌金属酶的基因,ERBB2(erb-b2 receptor tyrosine kinase 2,GeneID:2064)编码一种受体赖氨酸激酶的上皮生长因子受体。已有报道表明,CA9和ERBB2在包括膀胱癌在内的多种癌组织中表达。

CCL18(C-C motif chemokine ligand 18,Gene ID:6362)编码一种免疫调节相关的分泌蛋白,其在膀胱癌细胞中高表达,参与膀胱癌细胞的转移与侵袭。IGF2(insulinlike growth factor 2,Gene ID:3481)编码多肽生长因子胰岛素家族的一员,参与发育和生长,也被证明在膀胱癌组织高表达。MMP12(matrix metallopeptidase 12,GeneID:4321)编码基质金属蛋白酶的肽酶M10家族的一个成员,与胚胎发育、生殖、组织重塑以及一些疾病相关,其多态性与膀胱癌相关,其高表达也可作为辅助性诊断膀胱癌的依据。SGK2(serum/glucocorticoid regulated kinase 2,Gene ID:10110)编码一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,研究表明膀胱癌细胞中SGK2表达量高于普通膀胱上皮细胞。

LINC00565(Gene ID:100861555)是一种长非编码RNA,与卵巢癌、胶质母细胞瘤、肠癌、胃癌有关,未见其与膀胱癌之间关系的报道。PPP1R14D(protein phosphatase1regulatory inhibitor subunit 14D,Gene ID:54866)编码一种蛋白磷酸酶1的抑制蛋白,PPP1R14目前未见与膀胱癌之间的报道,在胰腺癌中,PPP1R14表达量越高,患者存活时间越长。

中国专利申请201810933616.2公开了种通过检测尿液样品中32个基因的表达模式来进行膀胱癌诊断的方法,所述基因为包括CA9、IGF2、ERBB2、MMP12、CCL18、SGK2、PPP1R14D、LINC00565在内的共32个基因,在106例临床样本(74例膀胱癌样本和32例对照样本)中验证发现,其准确率为93.4%。但检测的基因较多,成本较高。

发明内容

本发明要解决的问题是:提供一种简化待检基因数量的膀胱癌检测标记基因组合、检测试剂盒以及检测系统。

本发明的技术方案如下:

一组用于膀胱癌检测的基因,具体为:CA9、CCL18、ERBB2、IGF2、LINC00565、MMP12、PPP1R14D和SGK2。

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