[发明专利]一种通用的蛋白质组学样品制备方法及试剂盒有效
申请号: | 202110058812.1 | 申请日: | 2021-01-17 |
公开(公告)号: | CN114459848B | 公开(公告)日: | 2023-02-03 |
发明(设计)人: | 钟传奇;陈希;韩强强;陈继锋;许梦玲;刘宜子;尚骏;黄邵鑫;周欣;朱福远;陈沫先 | 申请(专利权)人: | 谱度众合(武汉)生命科技有限公司 |
主分类号: | G01N1/28 | 分类号: | G01N1/28;G01N1/34 |
代理公司: | 武汉臻诚专利代理事务所(普通合伙) 42233 | 代理人: | 胡星驰 |
地址: | 430070 湖北省武汉市*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 通用 蛋白质 样品 制备 方法 试剂盒 | ||
1.一种蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
蛋白质的提取和变性:向生物样本中加入含有SDS质量浓度(g/ml)在0.5%至10%的裂解液,破坏生物样本,使得蛋白质充分释放并且变性,获得蛋白质粗提液;所述裂解液含有5-20 mM还原剂、以及20-80 mM烷基化试剂;
残余SDS固定:向蛋白质粗提液中加入环糊精或环糊精衍生物溶液充分混匀,使得环糊精或环糊精衍生物与SDS的摩尔比在1-6:1之间,使得十二烷基磺酸钠与环糊精形成SDS-环糊精复合物;
酶解;加入样品中蛋白质总质量1/50至1/100的胰酶进行酶解;
脱除:在肽段纯化步骤中利用所述SDS-环糊精复合物与肽段的亲和能力不同将其分离;所述肽段纯化步骤包括脱盐、清洗和/或富集;
脱盐步骤具体包括:使用SDB-RPS填料脱除小分子盐类化合物、以及SDS-环糊精复合物,获得吸附有目标肽段的SDB-RPS填料;
所述脱除SDS-环糊精复合物,具体为采用酸性有机相清洗,所述酸性有机相pH值小于3;所述酸性有机相为1-5%的三氟乙酸或甲酸的有机相;所述有机相为乙腈、甲醇、丙酮、乙醇、乙酸乙酯、异丙醇中的一种或多种的组合;
富集步骤具体包括:使用目标肽段吸附剂吸附目标肽段,获得吸附有目标肽段的吸附剂;
洗脱:将目标肽段与填料和/或吸附剂分离,获得所述蛋白质组学样品,用于蛋白质组学检测。
2.如权利要求1所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,所述脱除步骤为磷酸化肽段富集,具体包括:使用IMAC、TiO2磷酸化肽段吸附剂吸附磷酸化肽段。
3.如权利要求1所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,所述环糊精或环糊精衍生物溶液为α-环糊精溶液、β-环糊精溶液、γ-环糊精溶液、羟丙基-α-环糊精溶液、羟丙基-β-环糊精溶液、以及羟丙基-γ-环糊精溶液中一种或多种的组合。
4.如权利要求1所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,所述环糊精或环糊精衍生物浓度在100 mM-250 mM之间。
5.如权利要求1所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,所述有机相为异丙醇。
6.如权利要求1至5任意一项所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,所述裂解液含有5-20 mM还原剂、以及20-80 mM烷基化试剂。
7.如权利要求6所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,所述还原剂为TCEP和/或DTT,所属烷基化试剂为CAA和/或IAA。
8.如权利要求7所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,所述裂解液含有10 mM的TCEP、以及40 mM的CAA,其pH值在7-9之间。
9.如权利要求1至5任意一项所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,包括步骤:
将所述加入有裂解液的生物性样本高温裂解和/或超声辅助溶解。
10.如权利要求9所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,所述高温裂解具体为:将加入有裂解液的生物性样本,加热至90-100 ℃,保温5-30分钟。
11.如权利要求9所述的蛋白质组学样品制备方法,其特征在于,所述超声辅助溶解具体为:将加入有裂解液的生物性样本,10-50 Hz超声10-60 s。
12.一种蛋白质组学样品制备试剂盒,其特征在于,包括含有十二烷基磺酸钠的裂解液、以及环糊精或环糊精衍生物溶液;所述裂解液含有质量浓度(g/mL)在0.5%至10%的十二烷基磺酸钠,所述环糊精或环糊精衍生物浓度在100 mM-250 mM之间;所述裂解液含有5-20mM还原剂、以及20-80 mM烷基化试剂。
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